RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 MCM5P33992 734 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 EVCP57679 992 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 PODNQ7Z5L7 613 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 TTLL6Q8N841 843 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 TGFB2P61812 414 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 ST3GAL1Q11201 340 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 TRDNQ13061 729 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 NFKBIBQ15653 356 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 SLF2Q8IX21 1173 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 DPEP1P16444 411 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 POLD1P28340 1107 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF2IP78347 998 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB7AO95365 584 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 BAG3O95817 575 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
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CAPNS1-207ENST00000589146 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 PRC1O43663 620 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 ANTXR2P58335 489 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 PPARAQ07869 468 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 BRF1Q92994 677 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 DOK7Q18PE1 504 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 SBK1Q52WX2 424 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT23Q9C075 422 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 PFKFB2O60825 505 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 FGD1P98174 961 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC93Q567U6 631 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF3C6Q969F1 213 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 MTA3Q9BTC8 594 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-207ENST00000589146 NEDD4P46934 1319 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 G3V3G9 751 aa26.88■■□□□ 1.89
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CAPNS1-207ENST00000589146 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
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CAPNS1-207ENST00000589146 CTR9Q6PD62 1173 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 NECAB1Q8N987 351 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMD1Q99460 953 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 C21orf2O43822 256 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 PLCG2P16885 1265 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 CERS5Q8N5B7 392 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM87BQ96K49 555 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 VPS33BQ9H267 617 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 SOGA3Q5TF21 947 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 CHST3Q7LGC8 479 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 LAMB1P07942 1786 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 B4E1Z4 1266 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 BRD1O95696 1058 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 APOBRQ0VD83 1088 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 MRIQ9BWK5 157 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 ECE2O60344 883 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 BTDP43251 543 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 NT5C2P49902 561 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 PIM2Q9P1W9 311 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-207ENST00000589146 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.83■■□□□ 1.89
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