RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.13■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 MAP3K9P80192 1104 aa28.11■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.11■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.1■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 CSADQ9Y600 493 aa28.1■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 ZBTB22O15209 634 aa28.09■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 FKTNO75072 461 aa28.09■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 RLBP1P12271 317 aa28.08■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 TCP10Q12799 353 aa28.08■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 NFIAQ12857 509 aa28.08■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.093e-7■■□□□ 12.7
PPP4C-212ENST00000567828 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 FAM151AQ8WW52 585 aa28.08■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 WRNIP1Q96S55 665 aa28.08■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 PTPN18Q99952 460 aa28.08■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 ABCF2Q9UG63 623 aa28.08■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
PPP4C-212ENST00000567828 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 HOOK2Q96ED9 719 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 OTUD5Q96G74 571 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 USP40Q9NVE5 1235 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 MIGA2Q7L4E1 593 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 HTTP42858 3142 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 POLA2Q14181 598 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 DCAF15Q66K64 600 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 GAKO14976 1311 aa28.04■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 CRHR2Q13324 411 aa28.04■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 GORABQ5T7V8 394 aa28.04■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 PI16Q6UXB8 463 aa28.04■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 SPDYE5A6NIY4 337 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 RGS19P49795 217 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 BRI3BPQ8WY22 251 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF341Q9BYN7 854 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 HPS5Q9UPZ3 1129 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 MAST2Q6P0Q8 1798 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 GTF2A2P52657 109 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 ATP8B2P98198 1209 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 CCL15Q16663 113 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 SSH3Q8TE77 659 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP4C-212ENST00000567828 RFX7Q2KHR2 1363 aa28.01■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 INPP5BP32019 993 aa28.01■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 ERO1BQ86YB8 467 aa28.01■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.01■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 RGS3P49796 1198 aa28■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 SOX10P56693 466 aa28■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 MECOMQ03112 1051 aa28■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 ERICH6Q7L0X2 663 aa28■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 SPATA5Q8NB90 893 aa28■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa28■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa27.99■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 BTDP43251 543 aa27.99■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 SLF2Q8IX21 1173 aa27.99■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF384Q8TF68 577 aa27.99■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 DOCK1Q14185 1865 aa27.98■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 MCAMP43121 646 aa27.98■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.98■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 IDI2Q9BXS1 227 aa27.98■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 CENPFP49454 3210 aa27.98■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 IRF6O14896 467 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 PPIL2Q13356 520 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 TNNI3KQ59H18 835 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 FAM43AQ8N2R8 423 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 PANK1Q8TE04 598 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 PTPRFP10586 1907 aa27.96■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 CD99L2Q8TCZ2 262 aa27.96■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 GPR108Q9NPR9 543 aa27.96■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF112Q9UJU3 913 aa27.96■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 TRIM17Q9Y577 477 aa27.96■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 ATRNL1Q5VV63 1379 aa27.96■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 PHIPQ8WWQ0 1821 aa27.95■■■□□ 2.07
PPP4C-212ENST00000567828 ENTPD3O75355 529 aa27.95■■■□□ 2.06
PPP4C-212ENST00000567828 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms