RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.77■■□□□ 1.24
GCSHP2-201ENST00000560971 GAKO14976 1311 aa22.77■■□□□ 1.24
GCSHP2-201ENST00000560971 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 ZIC5Q96T25 663 aa22.76■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.76■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 DCTPP1Q9H773 170 aa22.76■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.75■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 NFIAQ12857 509 aa22.75■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.75■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.75■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 SLF2Q8IX21 1173 aa22.75■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.75■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 BTDP43251 543 aa22.74■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM83AQ86UY5 434 aa22.74■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC102AQ96A19 550 aa22.74■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.73■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP2K2P36507 400 aa22.73■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 GSTO1P78417 241 aa22.73■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 TCP10Q12799 353 aa22.73■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.73■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.72■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.72■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC10A3P09131 477 aa22.72■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 NOGQ13253 232 aa22.72■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.72■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.72■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 WBP1LQ9NX94 342 aa22.72■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.72■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 LDHCP07864 332 aa22.71■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP3K11Q16584 847 aa22.71■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM151AQ8WW52 585 aa22.71■■□□□ 1.23
GCSHP2-201ENST00000560971 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.7■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.7■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.7■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 RGS3P49796 1198 aa22.69■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 RHBDL3P58872 404 aa22.69■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.69■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 IDI2Q9BXS1 227 aa22.69■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 FOXN1O15353 648 aa22.68■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.67■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 PICALMQ13492 652 aa22.67■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 AIDAQ96BJ3 306 aa22.67■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP5JP18859 108 aa22.66■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.66■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.66■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.66■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 GOLIM4O00461 696 aa22.65■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 ENTPD3O75355 529 aa22.65■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 CYP7A1P22680 504 aa22.65■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.65■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.64■■□□□ 1.22
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP3K12Q12852 859 aa22.64■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 AAMPQ13685 434 aa22.64■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.64■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.64■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 CSRNP1Q96S65 589 aa22.64■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 IGSF3O75054 1194 aa22.63■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 BAG3O95817 575 aa22.63■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP3K9P80192 1104 aa22.63■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 SPRYD7Q5W111 196 aa22.63■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 TEX11Q8IYF3 940 aa22.63■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 HOOK2Q96ED9 719 aa22.63■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.63■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 UNCXA6NJT0 531 aa22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP4CP60510 307 aa22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 VGLL4Q14135 290 aa22.62■■□□□ 1.21
GCSHP2-201ENST00000560971 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.62■■□□□ 1.21
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