RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	19.99	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		19.99	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	CETP	P11597	493 aa		19.98	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	PRDX5	P30044	214 aa		19.98	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	CAP1	Q01518	475 aa		19.98	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		19.98	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		19.98	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	IRF6	O14896	467 aa		19.97	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	PHKA1	P46020	1223 aa		19.97	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	TCP10	Q12799	353 aa		19.97	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	SNAPC2	Q13487	334 aa		19.97	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	ARHGEF6	Q15052	776 aa		19.97	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	MEIS3	Q99687	375 aa		19.97	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		19.97	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	AK9	Q5TCS8	1911 aa		19.97	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	19.96	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	PPIL2	Q13356	520 aa		19.96	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	COPRS	Q9NQ92	184 aa		19.96	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		19.96	■□□□□ 0.79
DDX11-222	ENST00000542777	POTEF	A5A3E0	1075 aa		19.95	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	BTBD19	C9JJ37	291 aa		19.95	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	SEMA3E	O15041	775 aa		19.95	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	INPP5B	P32019	993 aa		19.95	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	NFIA	Q12857	509 aa		19.95	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	19.95	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	USP40	Q9NVE5	1235 aa		19.95	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	CCER2	I3L3R5	266 aa		19.94	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	ADORA1	P30542	326 aa		19.94	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	PPAT	Q06203	517 aa		19.94	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC102B	Q68D86	513 aa		19.94	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		19.94	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	ARMC5	Q96C12	935 aa		19.94	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		19.94	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	TLR2	O60603	784 aa		19.93	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	TIMM10	P62072	90 aa		19.93	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		19.93	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	ZBTB22	O15209	634 aa		19.92	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	GNAI3	P08754	354 aa		19.92	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	19.92	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	19.92	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		19.92	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	KIF22	Q14807	665 aa		19.91	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		19.91	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		19.91	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	19.9	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	SRGAP3	O43295	1099 aa		19.9	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	NBPF11	Q86T75	865 aa		19.9	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		19.9	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	ABCF2	Q9UG63	623 aa		19.9	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		19.9	■□□□□ 0.78
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1B0GUL7	405 aa		19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	TFCP2	Q12800	502 aa		19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	RASGRF1	Q13972	1273 aa		19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	XAGE2	Q96GT9	111 aa		19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF333	Q96JL9	665 aa		19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	IDI2	Q9BXS1	227 aa		19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		19.89	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	HTT	P42858	3142 aa		19.88	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	GAK	O14976	1311 aa		19.88	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	PDHX	O00330	501 aa		19.88	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	RGS3	P49796	1198 aa		19.88	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	MTX1	Q13505	466 aa		19.88	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	19.88	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	SLF2	Q8IX21	1173 aa		19.88	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		19.88	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	ENTPD3	O75355	529 aa		19.87	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	C17orf99	Q6UX52	265 aa		19.87	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		19.87	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	CPA4	Q9UI42	421 aa		19.87	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	GNRH1	P01148	92 aa		19.86	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	DOCK2	Q92608	1830 aa		19.86	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	CXCL11	O14625	94 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	TRIM27	P14373	513 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	MOGS	Q13724	837 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	19.85	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	TNN	Q9UQP3	1299 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	19.85	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		19.84	■□□□□ 0.77
DDX11-222	ENST00000542777	BCAR3	O75815	825 aa		19.84	■□□□□ 0.77

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