RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532872.5

RPS3-218, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-218ENST00000532872 A0A1B0GUL7 405 aa15.88■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 TIMM10P62072 90 aa15.88■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.88■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 DCAF15Q66K64 600 aa15.88■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 FAM151AQ8WW52 585 aa15.88■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.88■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.88■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 WRNIP1Q96S55 665 aa15.88■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 PTPN18Q99952 460 aa15.88■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 SPDYE5A6NIY4 337 aa15.87■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 GTF2A2P52657 109 aa15.87■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 TFCP2Q12800 502 aa15.87■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 CRHR2Q13324 411 aa15.87■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 RASGRF1Q13972 1273 aa15.87■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.87■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 OTUD5Q96G74 571 aa15.87■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 XAGE2Q96GT9 111 aa15.87■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 SOX10P56693 466 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 ERO1BQ86YB8 467 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa15.86■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 TCP10Q12799 353 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 NFIAQ12857 509 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 CCL15Q16663 113 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 TMEM57Q8N5G2 664 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 USP40Q9NVE5 1235 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 ABCF2Q9UG63 623 aa15.85■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.135e-10■□□□□ 8.3
RPS3-218ENST00000532872 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 MIGA2Q7L4E1 593 aa15.84■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 SLF2Q8IX21 1173 aa15.84■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 ERO1AQ96HE7 468 aa15.84■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.84■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.84■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 TRIM17Q9Y577 477 aa15.84■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 GAKO14976 1311 aa15.84■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.84■□□□□ 0.13
RPS3-218ENST00000532872 CETPP11597 493 aa15.83■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.83■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 AK9Q5TCS8 1911 aa15.83■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 IRF6O14896 467 aa15.82■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 INPP5BP32019 993 aa15.82■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 SP3Q02447 781 aa15.82■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 PPATQ06203 517 aa15.82■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 PPIL2Q13356 520 aa15.82■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 SNAPC2Q13487 334 aa15.82■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 GORABQ5T7V8 394 aa15.82■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 IDI2Q9BXS1 227 aa15.82■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa15.82■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.82■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ENTPD3O75355 529 aa15.81■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.81■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.81■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.81■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.81■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.8■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa15.8■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.8■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 BTDP43251 543 aa15.8■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 RGS3P49796 1198 aa15.8■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 POLA2Q14181 598 aa15.8■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.8■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 SPATA5Q8NB90 893 aa15.8■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 EFCC1Q9HA90 598 aa15.8■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 HTTP42858 3142 aa15.79■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 BTBD19C9JJ37 291 aa15.79■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ATP8B2P98198 1209 aa15.79■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 MECOMQ03112 1051 aa15.79■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.79■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 SSH3Q8TE77 659 aa15.79■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 GPR108Q9NPR9 543 aa15.79■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 PTPN22Q9Y2R2 807 aa15.79■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ATRNL1Q5VV63 1379 aa15.78■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 DOCK2Q92608 1830 aa15.78■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa15.78■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 TLR2O60603 784 aa15.78■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa15.78■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 GSTO1P78417 241 aa15.78■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ARHGEF6Q15052 776 aa15.78■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 PI16Q6UXB8 463 aa15.78■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
RPS3-218ENST00000532872 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms