RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525778.5

SOGA3-203, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 4,077 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-203ENST00000525778 POSTNQ15063 836 aa20.5■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 KRT40Q6A162 431 aa20.5■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 TICAM2Q86XR7 235 aa20.5■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.5■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 MED4Q9NPJ6 270 aa20.5■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 ADCY9O60503 1353 aa20.5■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 ATP5JP18859 108 aa20.5■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.5■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 KRT9P35527 623 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 SPAG1Q07617 926 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 CASP8Q14790 479 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 SLC35F6Q8N357 371 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 CUTAO60888 179 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 PPARDQ03181 441 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 UBXN1Q04323 297 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC96Q2M329 555 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.49■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 RNF40O75150 1001 aa20.48■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.48■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.48■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 METTL24Q5JXM2 366 aa20.48■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.48■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 POTEDQ86YR6 584 aa20.48■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.48■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.48■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.48■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 ATP6V1AP38606 617 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 AKR1B10O60218 316 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 SASH1O94885 1247 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 HOXC9P31274 260 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 CABP4P57796 275 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 KIF5AQ12840 1032 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.47■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 TET3O43151 1660 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 ZMYND10O75800 440 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 EPS15P42566 896 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 KRT83P78385 493 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 TRIM47Q96LD4 638 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC114Q96M63 670 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 MYO6Q9UM54 1294 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 MYO1BO43795 1136 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 DPF2Q92785 391 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.46■□□□□ 0.87
SOGA3-203ENST00000525778 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 HOXB7P09629 217 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 IDEP14735 1019 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 TBC1D8O95759 1140 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 GNGT1P63211 74 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 BANK1Q8NDB2 785 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 SCLT1Q96NL6 688 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 TAF4BQ92750 862 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 STAMQ92783 540 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.45■□□□□ 0.86
SOGA3-203ENST00000525778 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms