RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, human

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2B-208	ENST00000511807	CACNB3	P54284	484 aa		13.96	□□□□□ -0.17
UBE2B-208	ENST00000511807	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.96	□□□□□ -0.17
UBE2B-208	ENST00000511807	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.96	□□□□□ -0.17
UBE2B-208	ENST00000511807	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.96	□□□□□ -0.17
UBE2B-208	ENST00000511807	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.96	□□□□□ -0.17
UBE2B-208	ENST00000511807	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.96	□□□□□ -0.17
UBE2B-208	ENST00000511807	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.96	□□□□□ -0.17
UBE2B-208	ENST00000511807	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.96	□□□□□ -0.17
UBE2B-208	ENST00000511807	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.95	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	POLA2	Q14181	598 aa		13.95	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.95	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	SLC34A2	O95436	690 aa		13.94	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	CRHR2	Q13324	411 aa		13.94	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.94	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	PTPN18	Q99952	460 aa		13.94	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.94	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.94	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	EYA2	O00167	538 aa		13.93	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	IGHD	P01880	384 aa		13.93	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.93	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	VGLL4	Q14135	290 aa		13.93	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.93	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.93	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.93	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.93	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.93	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.93	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	MAST3	O60307	1309 aa		13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	SLC5A1	P13866	664 aa		13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	FGFR2	P21802	821 aa		13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	CCL15	Q16663	113 aa		13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	SIL1	Q9H173	461 aa		13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.92	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.91	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	GTF2A2	P52657	109 aa		13.91	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	SP3	Q02447	781 aa		13.91	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.91	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.91	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	LPIN2	Q92539	896 aa		13.91	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.91	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.91	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.9	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.9	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.9	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.9	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.9	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.9	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.9	□□□□□ -0.18
UBE2B-208	ENST00000511807	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	CIAO1	O76071	339 aa		13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.89	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.88	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.88	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.88	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.88	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.88	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	CETP	P11597	493 aa		13.87	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	PRDX5	P30044	214 aa		13.87	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	TCP10	Q12799	353 aa		13.87	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.87	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.87	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.87	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	POTEF	A5A3E0	1075 aa		13.86	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	APBB1	O00213	710 aa		13.86	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
UBE2B-208	ENST00000511807	CAP1	Q01518	475 aa		13.86	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85 ms