RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM221A	A4D161	298 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TRIM37	O94972	964 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BPNT1	O95861	308 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NID1	P14543	1247 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MCM4	P33991	863 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CILP	O75339	1184 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CTSB	P07858	339 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SOX9	P48436	509 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DGKG	P49619	791 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MPP2	Q14168	576 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SVOP	Q8N4V2	548 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TM4SF5	O14894	197 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADAM11	O75078	769 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LIG1	P18858	919 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CDK8	P49336	464 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TREML4	Q6UXN2	200 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LRRC3	Q9BY71	257 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF862	O60290	1169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DLGAP3	O95886	979 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF165	P49910	485 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ILDR2	Q71H61	639 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KRT82	Q9NSB4	513 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ETFB	P38117	255 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RAC1	P63000	192 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CLC	Q05315	142 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RBL2	Q08999	1139 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	INPP5A	Q14642	412 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TRIM11	Q96F44	468 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PLVAP	Q9BX97	442 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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