RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	PLCG2	P16885	1265 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	AACS	Q86V21	672 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	APBB1	O00213	710 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	CACNB3	P54284	484 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	GRIK5	Q16478	980 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-231	ENST00000496246	BTD	P43251	543 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	MECOM	Q03112	1051 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TCP10	Q12799	353 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	ENTPD3	O75355	529 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TRPA1	O75762	1119 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	MCAM	P43121	646 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	SPRYD7	Q5W111	196 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	CSRNP1	Q96S65	589 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	WNK4	Q96J92	1243 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	GAK	O14976	1311 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TM4SF4	P48230	202 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	GTF2A2	P52657	109 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	PICALM	Q13492	652 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	RGS3	P49796	1198 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	AOX1	Q06278	1338 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	PCNT	O95613	3336 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	ZAP70	P43403	619 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	AAMP	Q13685	434 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-231	ENST00000496246	NFIA	Q12857	509 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	VGLL4	Q14135	290 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-231	ENST00000496246	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.77	□□□□□ -0.21

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