RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490444.2

PUM3-204, Transcript of pumilio RNA binding family member 3, human

TSL 5

Gene PUM3, Length 340 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM3-204	ENST00000490444	RAB6A	P20340	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	AFM	P43652	599 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	AOC3	Q16853	763 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	IGHA2	P01877	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	ZAP70	P43403	619 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	NFKB2	Q00653	900 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	IKBKE	Q14164	716 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	GPR152	Q8TDT2	470 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	STIM2	Q9P246	746 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	BRD1	O95696	1058 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	GLDC	P23378	1020 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	PDE4C	Q08493	712 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	FAM26D	Q5JW98	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	NUAK1	O60285	661 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	NFIX	Q14938	502 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	ADRB1	P08588	477 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	ZBTB39	O15060	712 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	CEACAM5	P06731	702 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	LINC00310	P59036	64 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	TTC16	Q8NEE8	873 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	SUV39H1	O43463	412 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	PCSK2	P16519	638 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	NPR3	P17342	541 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	ASPA	P45381	313 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	SERPINB4	P48594	390 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	OXCT1	P55809	520 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444		U3KQE9	123 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	ACPP	P15309	386 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	CES1	P23141	567 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	ZP2	Q05996	745 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	KCNA1	Q09470	495 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	HHIP	Q96QV1	700 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PUM3-204	ENST00000490444	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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