RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ADORA1	P30542	326 aa		21.29	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	RASGRF1	Q13972	1273 aa		21.29	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		21.29	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	GAK	O14976	1311 aa		21.29	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		21.28	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		21.28	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		21.28	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	IDI2	Q9BXS1	227 aa		21.28	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		21.28	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	CSAD	Q9Y600	493 aa		21.28	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		21.27	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	GORAB	Q5T7V8	394 aa		21.27	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNL1	Q8IU54	200 aa		21.27	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		21.27	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	FZD1	Q9UP38	647 aa		21.27	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	ENTPD3	O75355	529 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	LDHC	P07864	332 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	RLBP1	P12271	317 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	DGKZ	Q13574	1117 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE3A	Q14432	1141 aa		21.26	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR25	O00155	361 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF2A2	P52657	109 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTO1	P78417	241 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA5	Q8NB90	893 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	USP40	Q9NVE5	1235 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		21.25	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	ERO1B	Q86YB8	467 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	PANK1	Q8TE04	598 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		21.24	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNB3	P54284	484 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K10	Q02779	954 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	VGLL4	Q14135	290 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	TNNI3K	Q59H18	835 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	OPTN	Q96CV9	577 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCF2	Q9UG63	623 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		21.23	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	FKTN	O75072	461 aa		21.22	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D8	O95759	1140 aa		21.22	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	GJA5	P36382	358 aa		21.22	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS19	P49795	217 aa		21.22	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		21.22	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		21.22	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	21.22	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	ELP3	Q9H9T3	547 aa		21.22	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		21.22	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	21.22	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMB1	P07942	1786 aa		21.21	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	PPAT	Q06203	517 aa		21.21	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	21.21	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP85	Q6P2H3	762 aa		21.21	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	21.21	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		21.21	■□□□□ 0.99
HDAC10-216	ENST00000489424	OTOF	Q9HC10	1997 aa		21.2	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	21.2	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	MECOM	Q03112	1051 aa		21.2	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	WRNIP1	Q96S55	665 aa		21.2	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	21.19	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	CETP	P11597	493 aa		21.19	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	NFIA	Q12857	509 aa		21.19	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	PPIL2	Q13356	520 aa		21.19	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	COG6	Q9Y2V7	657 aa		21.19	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		21.19	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		21.19	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	MCAM	P43121	646 aa		21.18	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPN18	Q99952	460 aa		21.18	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D12	O60347	775 aa		21.17	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	BTD	P43251	543 aa		21.17	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	21.17	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAPC2	Q13487	334 aa		21.17	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		21.17	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		21.17	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	AK9	Q5TCS8	1911 aa		21.16	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	HMMR	O75330	724 aa		21.16	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCG2	P16885	1265 aa		21.16	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS3	P49796	1198 aa		21.16	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	RHBDL3	P58872	404 aa		21.16	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	TCP10	Q12799	353 aa		21.16	■□□□□ 0.98
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF6	Q15052	776 aa		21.16	■□□□□ 0.98

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