RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
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OPN3-204ENST00000469376 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa30.09■■■□□ 2.41
OPN3-204ENST00000469376 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
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OPN3-204ENST00000469376 SDF4Q9BRK5 362 aa30.08■■■□□ 2.41
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OPN3-204ENST00000469376 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa30.05■■■□□ 2.4
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OPN3-204ENST00000469376 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
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OPN3-204ENST00000469376 CDKL5O76039 1030 aa30.03■■■□□ 2.4
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OPN3-204ENST00000469376 NBPF3Q9H094 633 aa30■■■□□ 2.39
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OPN3-204ENST00000469376 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.99■■■□□ 2.39
OPN3-204ENST00000469376 RGL2O15211 777 aa29.99■■■□□ 2.39
OPN3-204ENST00000469376 ADRA2BP18089 450 aa29.99■■■□□ 2.39
OPN3-204ENST00000469376 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa29.99■■■□□ 2.39
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OPN3-204ENST00000469376 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa29.99■■■□□ 2.39
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OPN3-204ENST00000469376 RFC4P35249 363 aa29.98■■■□□ 2.39
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OPN3-204ENST00000469376 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
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OPN3-204ENST00000469376 ZNF202O95125 648 aa29.97■■■□□ 2.39
OPN3-204ENST00000469376 SKILP12757 684 aa29.97■■■□□ 2.39
OPN3-204ENST00000469376 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
OPN3-204ENST00000469376 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
OPN3-204ENST00000469376 NLRP12P59046 1061 aa29.97■■■□□ 2.39
OPN3-204ENST00000469376 TPM4P67936 248 aa29.97■■■□□ 2.39
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