RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452464.6

SCARB2-202, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SCARB2, Length 1,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-202ENST00000452464 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 ERO1BQ86YB8 467 aa14.75□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.75□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 WRNIP1Q96S55 665 aa14.75□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.74□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 SLC34A2O95436 690 aa14.74□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 CETPP11597 493 aa14.74□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 ADORA1P30542 326 aa14.74□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 ATP2B3Q16720 1220 aa14.74□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.74□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 PTPN18Q99952 460 aa14.74□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.74□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 AK9Q5TCS8 1911 aa14.74□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 SEMA3EO15041 775 aa14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 SRGAP3O43295 1099 aa14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 SNAPC2Q13487 334 aa14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 CENPFP49454 3210 aa14.73□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 LAMB1P07942 1786 aa14.72□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.72□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 KIF22Q14807 665 aa14.72□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 NBPF11Q86T75 865 aa14.72□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 FAM151AQ8WW52 585 aa14.72□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.72□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.72□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 GNAI3P08754 354 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 SLF2Q8IX21 1173 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 COPRSQ9NQ92 184 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-202ENST00000452464 PHKA1P46020 1223 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 PPATQ06203 517 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 PPIL2Q13356 520 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 HTTP42858 3142 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 IRF6O14896 467 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 TLR2O60603 784 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 GNAI2P04899 355 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 PRDX5P30044 214 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 TCP10Q12799 353 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 TFCP2Q12800 502 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 MTX1Q13505 466 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 PANK1Q8TE04 598 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 GNRH1P01148 92 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 USP40Q9NVE5 1235 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 TIMM10P62072 90 aa14.68□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 ARMC5Q96C12 935 aa14.68□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.67□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 BTBD19C9JJ37 291 aa14.67□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 ZBTB22O15209 634 aa14.67□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 CCDC102BQ68D86 513 aa14.67□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 GCC1Q96CN9 775 aa14.67□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 ABCF2Q9UG63 623 aa14.67□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 DOCK2Q92608 1830 aa14.67□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 INPP5BP32019 993 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 PRMT2P55345 433 aa14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 A0A1B0GUL7 405 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 GORABQ5T7V8 394 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.65□□□□□ -0.06
SCARB2-202ENST00000452464 ENTPD3O75355 529 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-202ENST00000452464 HOXD10P28358 340 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-202ENST00000452464 NFIAQ12857 509 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-202ENST00000452464 RASGRF1Q13972 1273 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-202ENST00000452464 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-202ENST00000452464 PI16Q6UXB8 463 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-202ENST00000452464 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-202ENST00000452464 XAGE2Q96GT9 111 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-202ENST00000452464 IDI2Q9BXS1 227 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-202ENST00000452464 PICK1Q9NRD5 415 aa14.64□□□□□ -0.07
SCARB2-202ENST00000452464 BRCA2P51587 3418 aa14.63□□□□□ -0.07
SCARB2-202ENST00000452464 POTEFA5A3E0 1075 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms