RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 CCDC85CA6NKD9 419 aa32.95■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 GPR25O00155 361 aa32.95■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 POLA2Q14181 598 aa32.95■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 DCAF15Q66K64 600 aa32.95■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 ITPRIPQ8IWB1 547 aa32.95■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 FAM151AQ8WW52 585 aa32.95■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 NEUROD6Q96NK8 337 aa32.95■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 ELP3Q9H9T3 547 aa32.95■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa32.94■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 OPTNQ96CV9 577 aa32.94■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 ATP8B2P98198 1209 aa32.93■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 VGLL4Q14135 290 aa32.93■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 SSH3Q8TE77 659 aa32.93■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 GJA5P36382 358 aa32.92■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 GORABQ5T7V8 394 aa32.92■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 GPR108Q9NPR9 543 aa32.91■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 ABCF2Q9UG63 623 aa32.91■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 GAKO14976 1311 aa32.91■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 USP40Q9NVE5 1235 aa32.9■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 AK9Q5TCS8 1911 aa32.9■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP32.89■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 FKTNO75072 461 aa32.89■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 MS4A1P11836 297 aa32.89■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 RLBP1P12271 317 aa32.89■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 WRNIP1Q96S55 665 aa32.89■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 ZNF341Q9BYN7 854 aa32.89■■■□□ 2.86
ODC1-204ENST00000446285 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 GTF2A2P52657 109 aa32.88■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 ERICH6Q7L0X2 663 aa32.88■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 SPDYE5A6NIY4 337 aa32.87■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa32.87■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 NFIAQ12857 509 aa32.86■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 ERO1BQ86YB8 467 aa32.86■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 SPATA5Q8NB90 893 aa32.86■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 MS4A4AQ96JQ5 239 aa32.86■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 IDI2Q9BXS1 227 aa32.86■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 HMG20BQ9P0W2 317 aa32.86■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 SURF6O75683 361 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 TCP10Q12799 353 aa32.85■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 C1orf115Q9H7X2 142 aa32.85■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 FAM198AQ9UFP1 575 aa32.85■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa32.85■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 ENTPD3O75355 529 aa32.84■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 OTUD5Q96G74 571 aa32.84■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa32.84■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa32.83■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 GSTO1P78417 241 aa32.83■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 TNNI3KQ59H18 835 aa32.83■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa32.83■■■□□ 2.85
ODC1-204ENST00000446285 RGS19P49795 217 aa32.82■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa32.82■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 PTPN18Q99952 460 aa32.82■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 RFX7Q2KHR2 1363 aa32.82■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 DOCK2Q92608 1830 aa32.81■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa32.81■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 LDHCP07864 332 aa32.81■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 MECOMQ03112 1051 aa32.81■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 CCL15Q16663 113 aa32.81■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 MIGA2Q7L4E1 593 aa32.81■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 ZNF112Q9UJU3 913 aa32.81■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 BTDP43251 543 aa32.8■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 RGS3P49796 1198 aa32.8■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 CRHR2Q13324 411 aa32.8■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 PPIL2Q13356 520 aa32.8■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 CCDC158Q5M9N0 1113 aa32.8■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 BRI3BPQ8WY22 251 aa32.8■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa32.79■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 IGSF3O75054 1194 aa32.79■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 CETPP11597 493 aa32.79■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 MCAMP43121 646 aa32.79■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 PPATQ06203 517 aa32.79■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 SNAPC2Q13487 334 aa32.78■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 TTC39AQ5SRH9 613 aa32.78■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 CEP85Q6P2H3 762 aa32.78■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 PANK1Q8TE04 598 aa32.78■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 NPM3O75607 178 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 PI16Q6UXB8 463 aa32.77■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 ERO1AQ96HE7 468 aa32.77■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
ODC1-204ENST00000446285 INPP5BP32019 993 aa32.76■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP32.76■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 DBNDD2Q9BQY9 259 aa32.76■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 RAI14Q9P0K7 980 aa32.76■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 HPS5Q9UPZ3 1129 aa32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms