RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 MYO1BO43795 1136 aa17.2■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP17.2■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC57Q2TAC2 916 aa17.2■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP100Q494V2 611 aa17.2■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 KIF28PB7ZC32 967 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 ISM2Q6H9L7 571 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GPR108Q9NPR9 543 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CEP126Q9P2H0 1117 aa17.19■□□□□ 0.34
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TOP3B-206ENST00000436282 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP6O43182 974 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TOP1P11387 765 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SYKP43405 635 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SLC39A14Q15043 492 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TAF7LQ5H9L4 462 aa17.19■□□□□ 0.34
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TOP3B-206ENST00000436282 TXLNBQ8N3L3 684 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa17.19■□□□□ 0.34
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TOP3B-206ENST00000436282 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA8BA8MQT2 603 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D8O95759 1140 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GPTP24298 496 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM139Q8IV31 216 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SYNE4Q8N205 404 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 HPS5Q9UPZ3 1129 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 HPSEQ9Y251 543 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 NWD2Q9ULI1 1742 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 M0R2C6 588 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CAPN2P17655 700 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TCIRG1Q13488 830 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 RGS22Q8NE09 1264 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TSPYL1Q9H0U9 437 aa17.18■□□□□ 0.34
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TOP3B-206ENST00000436282 ADORA1P30542 326 aa17.17■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 KAT6BQ8WYB5 2073 aa17.17■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CPLX1O14810 134 aa17.17■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SASH3O75995 380 aa17.17■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 MAP3K9P80192 1104 aa17.17■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 PIGBQ92521 554 aa17.17■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GJB4Q9NTQ9 266 aa17.17■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 PRC1O43663 620 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 OAS2P29728 719 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CASQ1P31415 396 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 KIF6Q6ZMV9 814 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 C4AP0C0L4 1744 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 C4BP0C0L5 1744 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM232C9JQI7 657 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 MUM1L1Q5H9M0 696 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 OLFM4Q6UX06 510 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 NEK11Q8NG66 645 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 ISCA1Q9BUE6 129 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 BTG4Q9NY30 223 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 KCPQ6ZWJ8 1503 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 PPP6R2O75170 966 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA8FQ08AF8 430 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TTC39AQ5SRH9 613 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 JMYQ8N9B5 988 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 MRFAP1Q9Y605 127 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 PPP2R3AQ06190 1150 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GPS2Q13227 327 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 WASHC4Q2M389 1173 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0G2JS52 829 aa17.14■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GNG11P61952 73 aa17.14■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 PNOCQ13519 176 aa17.14■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SHC4Q6S5L8 630 aa17.14■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SMARCE1Q969G3 411 aa17.14■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 OSBP2Q969R2 916 aa17.14■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 FANCLQ9NW38 375 aa17.14■□□□□ 0.34
TOP3B-206ENST00000436282 ST5P78524 1137 aa17.14■□□□□ 0.33
TOP3B-206ENST00000436282 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa17.14■□□□□ 0.33
TOP3B-206ENST00000436282 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
TOP3B-206ENST00000436282 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
TOP3B-206ENST00000436282 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
TOP3B-206ENST00000436282 EPC1Q9H2F5 836 aa17.14■□□□□ 0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ARFGAP3Q9NP61 516 aa17.14■□□□□ 0.33
TOP3B-206ENST00000436282 HAND2P61296 217 aa17.14■□□□□ 0.33
TOP3B-206ENST00000436282 RABGGTAQ92696 567 aa17.14■□□□□ 0.33
TOP3B-206ENST00000436282 XAGE2Q96GT9 111 aa17.14■□□□□ 0.33
TOP3B-206ENST00000436282 WDR24Q96S15 920 aa17.14■□□□□ 0.33
TOP3B-206ENST00000436282 INTS13Q9NVM9 706 aa17.14■□□□□ 0.33
TOP3B-206ENST00000436282 STX10O60499 249 aa17.13■□□□□ 0.33
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