RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 A0A1B0GUL7 405 aa24.95■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 RASGRF1Q13972 1273 aa24.95■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 CSADQ9Y600 493 aa24.95■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.94■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.94■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 GNAI2P04899 355 aa24.94■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 NFIAQ12857 509 aa24.94■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 CRHR2Q13324 411 aa24.94■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.94■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 FAM151AQ8WW52 585 aa24.94■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.94■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 HTTP42858 3142 aa24.94■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 SOX10P56693 466 aa24.93■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
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HLA-B-250ENST00000434333 XAGE2Q96GT9 111 aa24.93■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 WRNIP1Q96S55 665 aa24.93■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.93■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.92■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.92■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.92■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.92■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 GAKO14976 1311 aa24.91■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 TCP10Q12799 353 aa24.91■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 HOOK2Q96ED9 719 aa24.91■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.9■■□□□ 1.58
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HLA-B-250ENST00000434333 CCL15Q16663 113 aa24.9■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 DCAF15Q66K64 600 aa24.9■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.9■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 USP40Q9NVE5 1235 aa24.9■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.9■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 ERO1BQ86YB8 467 aa24.89■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.89■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.89■■□□□ 1.58
HLA-B-250ENST00000434333 INPP5BP32019 993 aa24.88■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 CAP1Q01518 475 aa24.88■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.88■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.88■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.88■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 TRIM17Q9Y577 477 aa24.88■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 IRF6O14896 467 aa24.87■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 ABCF2Q9UG63 623 aa24.87■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.87■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 PPIL2Q13356 520 aa24.86■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 POLA2Q14181 598 aa24.86■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.86■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF384Q8TF68 577 aa24.86■■□□□ 1.57
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HLA-B-250ENST00000434333 DOCK2Q92608 1830 aa24.86■■□□□ 1.57
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HLA-B-250ENST00000434333 ERO1AQ96HE7 468 aa24.85■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 RLBP1P12271 317 aa24.84■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
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HLA-B-250ENST00000434333 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
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HLA-B-250ENST00000434333 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.84■■□□□ 1.57
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HLA-B-250ENST00000434333 CETPP11597 493 aa24.83■■□□□ 1.57
HLA-B-250ENST00000434333 MECOMQ03112 1051 aa24.83■■□□□ 1.57
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HLA-B-250ENST00000434333 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
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HLA-B-250ENST00000434333 BTDP43251 543 aa24.82■■□□□ 1.56
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HLA-B-250ENST00000434333 SPATA5Q8NB90 893 aa24.82■■□□□ 1.56
HLA-B-250ENST00000434333 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.82■■□□□ 1.56
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HLA-B-250ENST00000434333 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HLA-B-250ENST00000434333 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
HLA-B-250ENST00000434333 MCAMP43121 646 aa24.81■■□□□ 1.56
HLA-B-250ENST00000434333 RHBDL3P58872 404 aa24.81■■□□□ 1.56
HLA-B-250ENST00000434333 SLF2Q8IX21 1173 aa24.81■■□□□ 1.56
HLA-B-250ENST00000434333 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HLA-B-250ENST00000434333 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.81■■□□□ 1.56
HLA-B-250ENST00000434333 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.8■■□□□ 1.56
HLA-B-250ENST00000434333 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.8■■□□□ 1.56
HLA-B-250ENST00000434333 EFCC1Q9HA90 598 aa24.8■■□□□ 1.56
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