RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 NFIAQ12857 509 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 PANK1Q8TE04 598 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 CEP85Q6P2H3 762 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 DOCK2Q92608 1830 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 VGLL4Q14135 290 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 PI16Q6UXB8 463 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM151AQ8WW52 585 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 TBC1D8O95759 1140 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 MCAMP43121 646 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 INHBEP58166 350 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNNI3KQ59H18 835 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 IFNL1Q8IU54 200 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 IDI2Q9BXS1 227 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP3K9P80192 1104 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTPN18Q99952 460 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 ELP3Q9H9T3 547 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 GPR25O00155 361 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 RGS19P49795 217 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 RHBDL3P58872 404 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 DGKZQ13574 1117 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPATA5Q8NB90 893 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 OPTNQ96CV9 577 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 MECOMQ03112 1051 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP40Q9NVE5 1235 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 ALDH1A1P00352 501 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 ABCF2Q9UG63 623 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 ENTPD3O75355 529 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP3K10Q02779 954 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 HOOK2Q96ED9 719 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 RGS3P49796 1198 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 TCP10Q12799 353 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 WRNIP1Q96S55 665 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 INPP5BP32019 993 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 BTDP43251 543 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 DCAF15Q66K64 600 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 CSADQ9Y600 493 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 MS4A1P11836 297 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERO1BQ86YB8 467 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLF2Q8IX21 1173 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 SIPA1L1O43166 1804 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 FOCADQ5VW36 1801 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 HTTP42858 3142 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 GORABQ5T7V8 394 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 OTUD5Q96G74 571 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.11■■□□□ 1.13
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