RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 TTC14Q96N46 770 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 MIS18AQ9NYP9 233 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 PALD1Q9ULE6 856 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TNS2Q63HR2 1409 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 HIP1O00291 1037 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SGSM2O43147 1006 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 FIBPO43427 364 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.068e-7■□□□□ 9.3
CTPS1-201ENST00000372616 APLP1P51693 650 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 VPS72Q15906 364 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 THAP11Q96EK4 314 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 C8orf37Q96NL8 207 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 KCND1Q9NSA2 647 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TTC41PQ6P2S7 1318 aa8.42□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SFI1A8K8P3 1242 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CTAGE5O15320 804 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 JUNDP17535 347 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 PSMA5P28066 241 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 EML3Q32P44 896 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF790Q6PG37 636 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 ERO1AQ96HE7 468 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TIGD1Q96MW7 591 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TNMDQ9H2S6 317 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 HEG1Q9ULI3 1381 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 H3BRB1 525 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CCP110O43303 1012 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 PTK2Q05397 1052 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TYRO3Q06418 890 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 DDB1Q16531 1140 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRNQ16849 979 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SARM1Q6SZW1 724 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 KIF18AQ8NI77 898 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 KIF1BPQ96EK5 621 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 GPATCH3Q96I76 525 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 LRCH3Q96II8 777 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.41□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 DKK1O94907 266 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 AK2P54819 239 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 GSDMDP57764 484 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TERF2Q15554 542 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CEP135Q66GS9 1140 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SPC24Q8NBT2 197 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CHMP4CQ96CF2 233 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM5Q9C035 493 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 SEPT3Q9UH03 358 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 USP21Q9UK80 565 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-201ENST00000372616 PAPPAQ13219 1627 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 GJB2P29033 226 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF75DP51815 510 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 KRT24Q2M2I5 525 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 TEX35Q5T0J7 233 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 MTMR6Q9Y217 621 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 PTGS1P23219 599 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 KCNJ6P48051 423 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 PTPN14Q15678 1187 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SSH3Q8TE77 659 aa8.39□□□□□ -1.07
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