RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX3-201ENST00000370002 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.03■■□□□ 1.6
PITX3-201ENST00000370002 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PITX3-201ENST00000370002 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PITX3-201ENST00000370002 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX3-201ENST00000370002 CAPN15O75808 1086 aa25.02■■□□□ 1.6
PITX3-201ENST00000370002 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX3-201ENST00000370002 CACNB3P54284 484 aa25.02■■□□□ 1.6
PITX3-201ENST00000370002 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX3-201ENST00000370002 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.02■■□□□ 1.6
PITX3-201ENST00000370002 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PITX3-201ENST00000370002 CSADQ9Y600 493 aa25.02■■□□□ 1.6
PITX3-201ENST00000370002 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 IFNL1Q8IU54 200 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 SPATA5Q8NB90 893 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 IDI2Q9BXS1 227 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 ABCF2Q9UG63 623 aa25.01■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 DGKZQ13574 1117 aa25■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 ERICH6Q7L0X2 663 aa25■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 USP40Q9NVE5 1235 aa25■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 HMG20BQ9P0W2 317 aa25■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 ENTPD3O75355 529 aa24.99■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 TNNI3KQ59H18 835 aa24.99■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.99■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 OPTNQ96CV9 577 aa24.99■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.99■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 GPR25O00155 361 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 TBC1D8O95759 1140 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 LDHCP07864 332 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 GSTO1P78417 241 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 VGLL4Q14135 290 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 CEP85Q6P2H3 762 aa24.98■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 GTF2A2P52657 109 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 ELP3Q9H9T3 547 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.97■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 GJA5P36382 358 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 ERO1BQ86YB8 467 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 PANK1Q8TE04 598 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.96■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 MECOMQ03112 1051 aa24.95■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 NFIAQ12857 509 aa24.95■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 WRNIP1Q96S55 665 aa24.95■■□□□ 1.59
PITX3-201ENST00000370002 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.95■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 MCAMP43121 646 aa24.94■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 FKTNO75072 461 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 TCP10Q12799 353 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 MAP3K10Q02779 954 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 PPATQ06203 517 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.93■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 BTDP43251 543 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 PTPN18Q99952 460 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.92■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 HMMRO75330 724 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 RGS3P49796 1198 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 PPIL2Q13356 520 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 PDE3AQ14432 1141 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.91■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 CETPP11597 493 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 RHBDL3P58872 404 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 PI16Q6UXB8 463 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 ZNF384Q8TF68 577 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 OTUD5Q96G74 571 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 RAI14Q9P0K7 980 aa24.9■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PITX3-201ENST00000370002 SNAPC2Q13487 334 aa24.89■■□□□ 1.57
PITX3-201ENST00000370002 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms