RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 RGPD5Q99666 1765 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 IRS1P35568 1242 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MYBPC2Q14324 1141 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 LONRF2Q1L5Z9 754 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 USPL1Q5W0Q7 1092 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TNS4Q8IZW8 715 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 XAGE2Q96GT9 111 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ETNK1Q9HBU6 452 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SCUBE2Q9NQ36 999 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PLAAQ9Y263 795 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRUQ92729 1446 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 EML1O00423 815 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ABLIM3O94929 683 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NASPP49321 788 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 LGR6Q9HBX8 967 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC4BQ9NT99 713 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NRXN1Q9ULB1 1477 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MAN1A1P33908 653 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ABTB2Q8N961 1025 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRB1O14514 1584 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FYCO1Q9BQS8 1478 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ERBB3P21860 1342 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 USP5P45974 858 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TEAD4Q15561 434 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 INAVAQ3KP66 663 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM74Q96NL1 305 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TNIKQ9UKE5 1360 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 DGKGP49619 791 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SYCP2LQ5T4T6 812 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SPG7Q9UQ90 795 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SHTN1A0MZ66 631 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CDK2AP1O14519 115 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PDPK1O15530 556 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CRKP46108 304 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ATP2B2Q01814 1243 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FAM83BQ5T0W9 1011 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NBPF14Q5TI25 921 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA0319Q5VV43 1072 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FERMT3Q86UX7 667 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA0825Q8IV33 1275 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PHC3Q8NDX5 983 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 GGT7Q9UJ14 662 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa3.26□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 LILRA1O75019 489 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 STAU1O95793 577 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ECE1P42892 770 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 OXLD1Q5BKU9 147 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 C14orf80Q86SX3 495 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ZMYM5Q9UJ78 669 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ATP10AO60312 1499 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SCGB1D2O95969 90 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM27P14373 513 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINB3P29508 390 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 GDF10P55107 478 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FAM102BQ5T8I3 360 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 GALNT12Q8IXK2 581 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC74AQ96AQ1 378 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM8Q9BZR9 551 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MUC3BQ9H195 1237 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 UNC93B1Q9H1C4 597 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FGD6Q6ZV73 1430 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PZPP20742 1482 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FAM221AA4D161 298 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms