RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.32■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.32■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.31■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 RASGRF1Q13972 1273 aa22.31■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.31■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 TEPSINQ96N21 525 aa22.31■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.31■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 GPR108Q9NPR9 543 aa22.31■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.31■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 CACNB3P54284 484 aa22.3■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.3■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.3■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 PDE4AP27815 886 aa22.29■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.29■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 TNNI2P48788 182 aa22.28■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 TNNI3KQ59H18 835 aa22.28■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 RNF186Q9NXI6 227 aa22.28■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.28■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.28■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.27■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.27■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 UNCXA6NJT0 531 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 TRPA1O75762 1119 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 FAM83AQ86UY5 434 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 SKAP1Q86WV1 359 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 SPRYD7Q5W111 196 aa22.25■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 AACSQ86V21 672 aa22.25■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.25■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 GORABQ5T7V8 394 aa22.24■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 PI16Q6UXB8 463 aa22.24■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.24■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 TM4SF4P48230 202 aa22.23■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.23■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 ABCF2Q9UG63 623 aa22.23■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.23■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.23■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 SPATA5Q8NB90 893 aa22.23■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 GAKO14976 1311 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 MCAMP43121 646 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 WNK4Q96J92 1243 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 BCL11AQ9H165 835 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 STAP2Q9UGK3 403 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.21■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 NFIAQ12857 509 aa22.21■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.21■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.21■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTX4-201ENST00000293922 MX1P20591 662 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 GJA5P36382 358 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 RGS3P49796 1198 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 PDE1AP54750 535 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 SREBF2Q12772 1141 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 ZNF384Q8TF68 577 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 FAM151AQ8WW52 585 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 USP40Q9NVE5 1235 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 OTOFQ9HC10 1997 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 MECOMQ03112 1051 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 CAPN15O75808 1086 aa22.18■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 TCP10Q12799 353 aa22.18■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 SLF2Q8IX21 1173 aa22.18■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 ELP3Q9H9T3 547 aa22.18■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 MAP3K9P80192 1104 aa22.17■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 VGLL4Q14135 290 aa22.17■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 GPATCH3Q96I76 525 aa22.17■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.17■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.17■■□□□ 1.14
PTX4-201ENST00000293922 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.17■■□□□ 1.14
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