RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 GUCD1Q96NT3 240 aa21.11■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 H7C1W4 665 aa21.1■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 ELNP15502 786 aa21.1■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 PPATQ06203 517 aa21.1■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.1■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.1■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.1■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.09■□□□□ 0.97
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SPCS1-201ENST00000233025 KSR2Q6VAB6 950 aa21.09■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 PXYLP1Q8TE99 480 aa21.09■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.09■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 AK9Q5TCS8 1911 aa21.09■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.08■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 CRKP46108 304 aa21.08■□□□□ 0.97
SPCS1-201ENST00000233025 FLT3LGP49771 235 aa21.08■□□□□ 0.97
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SPCS1-201ENST00000233025 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
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SPCS1-201ENST00000233025 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
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SPCS1-201ENST00000233025 CYP2C8P10632 490 aa21.04■□□□□ 0.96
SPCS1-201ENST00000233025 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.03■□□□□ 0.96
SPCS1-201ENST00000233025 FAM83AQ86UY5 434 aa21.03■□□□□ 0.96
SPCS1-201ENST00000233025 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
SPCS1-201ENST00000233025 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.03■□□□□ 0.96
SPCS1-201ENST00000233025 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.02■□□□□ 0.96
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.02■□□□□ 0.96
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SPCS1-201ENST00000233025 HOOK2Q96ED9 719 aa21.02■□□□□ 0.96
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.02■□□□□ 0.96
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SPCS1-201ENST00000233025 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.01■□□□□ 0.95
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SPCS1-201ENST00000233025 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.97■□□□□ 0.95
SPCS1-201ENST00000233025 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.97■□□□□ 0.95
SPCS1-201ENST00000233025 PFASO15067 1338 aa20.97■□□□□ 0.95
SPCS1-201ENST00000233025 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
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SPCS1-201ENST00000233025 DOCK1Q14185 1865 aa20.96■□□□□ 0.95
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SPCS1-201ENST00000233025 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
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SPCS1-201ENST00000233025 HMGCRP04035 888 aa20.94■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 GNAI1P63096 354 aa20.94■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 FOXO4P98177 505 aa20.94■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.94■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 G2E3Q7L622 706 aa20.93■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 TSPYL6Q8N831 410 aa20.93■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.93■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.93■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 UBE4AQ14139 1066 aa20.92■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.92■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 COA7Q96BR5 231 aa20.92■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SPCS1-201ENST00000233025 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.92■□□□□ 0.94
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