RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000227089.1

Ankrd28-204, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

BASIC

Gene Ankrd28, Length 3,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cdc37Q61081 379 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 MmeQ61391 750 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Snd1Q78PY7 910 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cep55Q8BT07 462 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 AidaQ8C4Q6 305 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Paf1Q8K2T8 535 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tada3Q8R0L9 432 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Terf2ipQ91VL8 393 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 PpanQ91YU8 470 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cep89Q9CZX2 791 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 CenphQ9QYM8 241 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Magi2Q9WVQ1 1275 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Krt18P05784 423 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Scp2P32020 547 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Sdc2P43407 202 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mcm5P49718 733 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cct5P80316 541 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 CtcfQ61164 736 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ccdc155Q80VJ8 648 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Necab1Q8BG18 352 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Larp6Q8BN59 492 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Golim4Q8BXA1 655 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cd209bQ8CJ91 325 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 SdsQ8VBT2 327 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ferd3lQ923Z4 168 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trim11Q99PQ2 467 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cfap45Q9D9U9 551 aa5.29□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Prr29B1ARI9 187 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ets1P27577 440 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rfc1P35601 1131 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Grm8P47743 908 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ctdnep1Q3TP92 244 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tgfb1i1Q62219 461 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Sdad1Q80UZ2 687 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Zc3h6Q8BYK8 1177 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ccdc186Q8C9S4 917 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Nek9Q8K1R7 984 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Dnm1P39053 867 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Top1Q04750 767 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Washc4Q3UMB9 1173 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Smc4Q8CG47 1286 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cgref1Q8R1U2 281 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Speer4bQ9D9F7 267 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Naa16Q9DBB4 864 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Irx5Q9JKQ4 484 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pex14Q9R0A0 376 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rgs12Q8CGE9 1381 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Skor2A7M7C7 1008 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Prl7a2O54831 253 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tubb4bP68372 445 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pfkfb1P70266 471 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Q3UJC8 639 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ppp1r7Q3UM45 361 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Acbd5Q5XG73 508 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 March6Q6ZQ89 909 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Epc1Q8C9X6 813 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Kcnv2Q8CFS6 562 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 TatQ8QZR1 454 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Vps37cQ8R105 352 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Hps3Q91VB4 1002 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cbx8Q9QXV1 362 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Clic4Q9QYB1 253 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Stk25Q9Z2W1 426 aa5.28□□□□□ -1.56
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm5624F6ZZG8 207 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mdh1P14152 334 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tubb5P99024 444 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Vps54Q5SPW0 977 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Irf9Q61179 399 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Sycp1Q62209 993 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Erlin1Q91X78 346 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Atg3Q9CPX6 314 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tbc1d2B1AVH7 922 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rad51ap2G3UW63 976 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Kifc2O08672 792 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 LtkP08923 888 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cnnm1Q0GA42 951 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Fam107bQ3TGF2 131 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm28047Q3US59 414 aa5.27□□□□□ -1.57
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 PsdQ5DTT2 1024 aa5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.5 ms