RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ltbp1	Q8CG19	1712 aa		32.32	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Arfgef1	G3X9K3	1846 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Casp1	P29452	402 aa		32.31	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355		Q3TYL0	343 aa		32.31	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hmces	Q8R1M0	353 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dusp10	Q9ESS0	483 aa		32.31	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Afdn	Q9QZQ1	1820 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbbp6	P97868	1790 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myl10	Q62082	202 aa		32.31	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sept9	Q80UG5	583 aa		32.31	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	9230110C19Rik	Q8CC70	267 aa		32.31	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mcam	Q8R2Y2	648 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rhbdl3	P58873	404 aa		32.3	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cplx1	P63040	134 aa		32.3	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pc	Q05920	1178 aa		32.3	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cpvl	Q9D3S9	478 aa		32.3	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Llgl2	Q3TJ91	1027 aa		32.3	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Acnat2	Q8BGG9	420 aa		32.3	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ranbp6	Q8BIV3	1105 aa		32.3	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hnrnpul1	Q8VDM6	859 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sh3bp5l	Q99LH9	392 aa		32.3	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm43638	A0A0J9YU36	694 aa		32.29	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tuft1	O08970	390 aa		32.29	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Siah1a	P61092	282 aa		32.29	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prkag3	Q8BGM7	489 aa		32.29	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dbndd1	Q9CZ00	160 aa		32.29	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Inhbe	O08717	350 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hspa1l	P16627	641 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Evc2	Q8K1G2	1220 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mei1	Q9D4I2	1268 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Wtap	Q9ER69	396 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lgr5	Q9Z1P4	907 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myo3b	Q1EG27	1305 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pramel3	A2AHA7	463 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ankrd63	A2ARS0	390 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm7903	A2AWL1	463 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	AV320801	A2AWL3	467 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm15023	L7MUB4	467 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myh6	Q02566	1938 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slitrk3	Q810B9	980 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Afg3l2	Q8JZQ2	802 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Wasf1	Q8R5H6	559 aa		32.28	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mtx1	P47802	317 aa		32.27	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cnpy3	Q9DAU1	276 aa		32.27	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cobl	Q5NBX1	1337 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pde11a	P0C1Q2	933 aa		32.27	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbm15b	Q6PHZ5	887 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355		Q8BT18	775 aa		32.27	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nop2	Q922K7	793 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
Ldb1-208	ENSMUST00000185355		A0A1W2P7S8	802 aa		32.26	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dnm1	P39053	867 aa		32.26	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cdc5l	Q6A068	802 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ttc12	Q8BW49	704 aa		32.26	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	U2af2	P26369	475 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Olfr118	Q7TRJ6	321 aa		32.25	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vps37d	Q810I0	261 aa		32.25	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tsen34	Q8BMZ5	316 aa		32.25	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lrrc2	Q8VDB8	371 aa		32.25	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Suclg2	Q9Z2I8	433 aa		32.25	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fam170a	Q66LM6	333 aa		32.25	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Iqcg	Q80W32	419 aa		32.25	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Il15	P48346	162 aa		32.24	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ppp1r21	Q3TDD9	780 aa		32.24	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tex2	Q6ZPJ0	1128 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sec62	Q8BU14	398 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nucb2	P81117	420 aa		32.23	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Znf609	Q8BZ47	1413 aa		32.23	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Heg1	E9Q7X6	1337 aa		32.23	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cavin1	O54724	392 aa		32.23	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Eva1c	P58659	440 aa		32.23	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rps8	P62242	208 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kcnf1	Q7TSH7	493 aa		32.23	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rtn1	Q8K0T0	780 aa		32.23	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hps3	Q91VB4	1002 aa		32.23	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sde2	Q8K1J5	448 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Aox3	G3X982	1335 aa		32.22	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ncapg	E9PWG6	1004 aa		32.22	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tnni2	P13412	182 aa		32.22	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Srp68	Q8BMA6	625 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Terb1	Q8C0V1	768 aa		32.22	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ppfibp2	O35711	882 aa		32.21	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Acot9	Q9R0X4	439 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zfyve9	A2A8R0	1397 aa		32.2	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Atp2b1	G5E829	1220 aa		32.2	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dnajc2	P54103	621 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Epha2	Q03145	977 aa		32.2	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sgsm1	Q8BPQ7	1093 aa		32.2	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gse1	Q3U3C9	1213 aa		32.19	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cfap69	Q8BH53	942 aa		32.19	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Adarb2	Q9JI20	745 aa		32.19	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	4930523C07Rik	E9Q2T4	99 aa		32.19	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pfkfb1	P70266	471 aa		32.19	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ano10	Q8BH79	659 aa		32.19	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zfp202	Q8C879	641 aa		32.19	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rtcb	Q99LF4	505 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bap1	Q99PU7	728 aa		32.19	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Syt10	Q9R0N4	523 aa		32.19	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myh13	B1AR69	1938 aa		32.18	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dhx40	Q6PE54	779 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Celf1	P28659	486 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74

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