RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 H3BRN7 92 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 GP9P14770 177 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPREB3Q9UKI3 123 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSPG4Q6UVK1 2322 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPIFP30405 207 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRELID1Q9Y255 219 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 GGTLC3B5MD39 225 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR183P32249 361 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPL23P62829 140 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHRDL1Q9BU40 450 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADMP35318 185 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADIRFQ15847 76 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF343Q6P1L6 599 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF600Q6ZNG1 722 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 C15orf54Q8N8G6 183 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRGV3P03979 118 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLEC3BP05452 202 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 NBEAP1P0C6P0 100 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 S100A7P31151 101 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC140Q96MF4 163 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 DERL1Q9BUN8 251 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF24Q9Y225 148 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 LEMD1Q68G75 181 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCEAL7Q9BRU2 100 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q6ZS46 218 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM242Q9NWH2 141 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 CRYBB3P26998 211 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLEC19AQ6UXS0 136 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 USMG5Q96IX5 58 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 CREBBPQ92793 2442 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 CXorf65A6NEN9 183 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 TGOLN2O43493 480 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTDSP1Q9GZU7 261 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 TPPP2P59282 170 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 BLNKQ8WV28 456 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 ELOVL1Q9BW60 279 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF98A6NK75 572 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 C9JCJ5 164 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 BMPR1BO00238 502 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF329Q86UD4 541 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 RABAC1Q9UI14 185 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 MT-ND4LP03901 98 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYCNOSP40205 109 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 HELTA6NFD8 242 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 COLCA2A8K830 154 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGLV1-40P01703 118 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPL35P42766 123 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 RANP62826 216 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 CFHR3Q02985 330 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 RELQ04864 619 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF212Q495C1 297 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC01551Q86U37 167 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR4F17Q8NGA8 305 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 C2CD4CQ8TF44 421 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM190Q8WZ59 177 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNB4Q9HAV0 340 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 LY96Q9Y6Y9 160 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 BAHCC1Q9P281 2608 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 ISOC2Q96AB3 205 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRSS22Q9GZN4 317 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLDN34H7C241 214 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOMM20LQ6UXN7 152 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2BAQ96A08 127 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANAPC16Q96DE5 110 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD5LO43866 347 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 PF4V1P10720 104 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF414Q96IQ9 312 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZFAND3Q9H8U3 227 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF586Q9NXT0 402 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSMD1Q96PZ7 3565 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A0G2JLM5 398 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 PGPA6NDG6 321 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM89A2RUT3 159 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGLC2P0DOY2 106 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAB9AP51151 201 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q9H3A6 140 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 EPDR1Q9UM22 224 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDZD2O15018 2839 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 PEX7O00628 323 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD99P14209 185 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNG4P50150 75 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 CNN1P51911 297 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAS2R60P59551 318 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM86BQ8N661 226 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa22.54■■□□□ 1.2
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