RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200		X6R8D5	127 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	SSSCA1	O60232	199 aa		15.79	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-DRB4	P13762	266 aa		15.79	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		15.79	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		15.79	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		15.79	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		15.79	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		15.78	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	AKR1C1	Q04828	323 aa		15.78	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		15.78	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		15.78	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	C17orf77	Q96MU5	243 aa		15.78	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	MFF	Q9GZY8	342 aa		15.78	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		15.78	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		15.77	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TCRB	P04435	133 aa		15.77	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMB3	P49720	205 aa		15.77	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		15.77	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		15.77	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		15.77	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNK	O75909	580 aa		15.77	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	MIF	P14174	115 aa		15.77	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB1	P60022	68 aa		15.77	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		15.77	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	HRH4	Q9H3N8	390 aa		15.77	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF98	A6NK75	572 aa		15.76	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ID1	P41134	155 aa		15.76	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		15.76	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC32	Q9BV29	185 aa		15.76	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		15.76	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ISLR	O14498	428 aa		15.75	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ORM2	P19652	201 aa		15.75	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R30	P59541	319 aa		15.75	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		15.75	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00052	Q96N35	136 aa		15.75	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		15.75	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		15.75	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		15.74	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	FNDC10	F2Z333	226 aa		15.74	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TSC22D2	O75157	780 aa		15.74	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SCGB1D2	O95969	90 aa		15.74	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		15.74	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	DLK1	P80370	383 aa		15.74	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		15.74	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		15.74	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		15.74	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	XCL2	Q9UBD3	114 aa		15.74	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		15.73	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SMCO3	A2RU48	225 aa		15.73	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	C7orf66	A4D0T2	115 aa		15.73	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	LY6G6C	O95867	125 aa		15.73	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		15.73	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		15.73	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A22	Q9H936	323 aa		15.73	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT15	Q9NV35	164 aa		15.73	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200		K7EPK0	472 aa		15.72	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	GALR1	P47211	349 aa		15.72	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	MEOX2	P50222	304 aa		15.72	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	PLP1	P60201	277 aa		15.72	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	RSG1	Q9BU20	258 aa		15.72	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		15.72	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		15.72	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	CCS	O14618	274 aa		15.71	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	IL5	P05113	134 aa		15.71	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL16	Q0P5N6	197 aa		15.71	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF709	Q8N972	641 aa		15.71	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		15.71	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	C20orf173	Q96LM9	149 aa		15.71	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		15.71	■□□□□ 0.11
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BRN7	92 aa		15.7	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SELENOT	P62341	195 aa		15.7	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		15.7	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		15.7	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR82	Q96P67	336 aa		15.7	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		15.7	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		15.7	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	DOK5	Q9P104	306 aa		15.7	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200		F6UB75	175 aa		15.69	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV3-20	P01619	116 aa		15.69	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00869	P0C866	280 aa		15.69	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	S100A7	P31151	101 aa		15.69	■□□□□ 0.1

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