RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 MBP02144 154 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 AREGP15514 252 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 M6PRP20645 277 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 BLOC1S1P78537 153 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 TEPPQ6URK8 271 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 COMMD7Q86VX2 200 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 H3BUA1 57 aa6.95□□□□□ -1.3
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SMAD3-215ENST00000560424 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 RAB31Q13636 194 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 BTNL8Q6UX41 500 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.95□□□□□ -1.3
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SMAD3-215ENST00000560424 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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SMAD3-215ENST00000560424 FGF7P21781 194 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 OPRK1P41145 380 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 MFAP2P55001 183 aa6.94□□□□□ -1.3
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SMAD3-215ENST00000560424 GAMTQ14353 236 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF709Q8N972 641 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 THAP8Q8NA92 274 aa6.94□□□□□ -1.3
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SMAD3-215ENST00000560424 RSG1Q9BU20 258 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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SMAD3-215ENST00000560424 I3L2K1 104 aa6.93□□□□□ -1.3
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SMAD3-215ENST00000560424 SELENOTP62341 195 aa6.93□□□□□ -1.3
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SMAD3-215ENST00000560424 RAB19A4D1S5 217 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 TEX46H3BTG2 121 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 K7EIM0 57 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 AGPAT2O15120 278 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 HBE1P02100 147 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 TCTAP57738 103 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 AKR1C1Q04828 323 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZRG5 221 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZWC4 215 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 USMG5Q96IX5 58 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 TRGV9Q99603 122 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 TXN2Q99757 166 aa6.92□□□□□ -1.3
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SMAD3-215ENST00000560424 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 SMCO3A2RU48 225 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 MT-CO2P00403 227 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV12-3P01733 135 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 PRH1P02810 166 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 REG1AP05451 166 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 DEFA4P12838 97 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 DEFA5Q01523 94 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 UQCC3Q6UW78 93 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 MARC2Q969Z3 335 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 CXorf58Q96LI9 332 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.91□□□□□ -1.3
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