RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531352.5

ACER3-210, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 2,093 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-210ENST00000531352 GGACTQ9BVM4 153 aa8.7□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.7□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 A0A1W2PS18 150 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 OR11H12B2RN74 326 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 MORN5Q5VZ52 161 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 MIC13Q5XKP0 118 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 PATE2Q6UY27 113 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 STX12Q86Y82 276 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 CITED4Q96RK1 184 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 B9D2Q9BPU9 175 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 LINC00869P0C866 280 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 S100A11P31949 105 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 HSPB11Q9Y547 144 aa8.69□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 RNF222A6NCQ9 220 aa8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 FABP1P07148 127 aa8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 FGF7P21781 194 aa8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 RAP2BP61225 183 aa8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 BAXQ07812 192 aa8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 C17orf77Q96MU5 243 aa8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 A8MZ25 164 aa8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 DCANP1Q8TF63 244 aa8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.68□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 BMI1P35226 326 aa8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 CAMLGP49069 296 aa8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 HBG1P69891 147 aa8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 HBG2P69892 147 aa8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 RSG1Q9BU20 258 aa8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 ARL6Q9H0F7 186 aa8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 FBXL17Q9UF56 701 aa8.67□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 OR4C46A6NHA9 309 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 PET100P0DJ07 73 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 DEFB1P60022 68 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 SELENOTP62341 195 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 TUBA4BQ9H853 241 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 SLC25A22Q9H936 323 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 ZNF98A6NK75 572 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 K7EQG2 157 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 CD5P06127 495 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 OR5G3P0C626 314 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 PLP1P60201 277 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 PRR20EP86478 221 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 PRR20CP86479 221 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 PRR20DP86480 221 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 PRR20BP86481 221 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 PRR20AP86496 221 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.66□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.65□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.65□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 PAFAH1B2P68402 229 aa8.65□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 OPCMLQ14982 345 aa8.65□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 ATP6V1FQ16864 119 aa8.65□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.65□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 ATP5SQ99766 215 aa8.65□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.65□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.65□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.65□□□□□ -1.02
ACER3-210ENST00000531352 ARPC5O15511 151 aa8.65□□□□□ -1.03
ACER3-210ENST00000531352 HYPMO75409 117 aa8.65□□□□□ -1.03
ACER3-210ENST00000531352 HAGHQ16775 308 aa8.65□□□□□ -1.03
ACER3-210ENST00000531352 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.65□□□□□ -1.03
ACER3-210ENST00000531352 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.65□□□□□ -1.03
ACER3-210ENST00000531352 ZNF546Q86UE3 836 aa8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms