RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 SERF1AO75920 110 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 ZNF562Q6V9R5 426 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 DTX2Q86UW9 622 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 VCX2Q9H322 139 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 RPL15P61313 204 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 E9PQ18 207 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 TCRAP04437 139 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 IGF2-ASQ6U949 168 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 ZNF581Q9P0T4 197 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 CYSLTR1Q9Y271 337 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 C15orf62A8K5M9 175 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 ADMP35318 185 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 ZNF138P52744 262 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 FOXL1Q12952 345 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 HBDP02042 147 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 RASL11AQ6T310 242 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 FRMPD3Q5JV73 1810 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 OR13C6PQ8NH95 151 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 NRN1Q9NPD7 142 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 ANAPC10Q9UM13 185 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 NTF4P34130 210 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 CFHR2P36980 270 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 LINC01559Q495D7 138 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 NPIPB5A8MRT5 1133 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 SRD5A1P18405 259 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 PLP1P60201 277 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 NUDT11Q96G61 164 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1671Q9BY89 1806 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 DNAL4O96015 105 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 LINC00614P0C842 121 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 CD33P20138 364 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 CFAP161Q6P656 301 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 RNF114Q9Y508 228 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZR03 302 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 TDGF1P13385 188 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 TEX36Q5VZQ5 186 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 FAM19A2Q8N3H0 131 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 FAM215AQ9Y5M1 114 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 PGPEP1LA6NFU8 196 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1-16P04430 117 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 CNTFRP26992 372 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 ERVK11-1P61568 191 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 RFNGQ9Y644 331 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 FANCMQ8IYD8 2048 aa13.83□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa13.83□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 IGHV1-69P01742 117 aa13.83□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 Q5PR19 223 aa13.83□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 LINC00311Q8N616 119 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 CACNA1HO95180 2353 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 ROS1P08922 2347 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 RNF223E7ERA6 249 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 COTL1Q14019 142 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 LINC01551Q86U37 167 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 J3QLI3 93 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 CTAG1AP78358 180 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 HS3ST6Q96QI5 342 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 VOPP1Q96AW1 172 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 TOMM7Q9P0U1 55 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 CACNA1GO43497 2377 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 PPIFP30405 207 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 PDE6HQ13956 83 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 A0A0G2JRQ6 117 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 J3QKU1 62 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H2BKO60814 126 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H2BJP06899 126 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 ZNF688P0C7X2 276 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H2BOP23527 126 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H2BBP33778 126 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H2BDP58876 126 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H2BCP62807 126 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 HIST2H2BEQ16778 126 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 LCNL1Q6ZST4 164 aa13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101 ms