RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	FGL1	Q08830	312 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	THAP6	Q8TBB0	222 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF125	Q96EQ8	232 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	DFFB	O76075	338 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	MPC2	O95563	127 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	LYZ	P61626	148 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2F1	Q13607	317 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF2	Q99496	336 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	TENM2	Q9NT68	2774 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE6A	A0A183	80 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	HELT	A6NFD8	242 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNK	O75909	580 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	BAX	Q07812	192 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	FCN2	Q15485	313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	TCF24	Q7RTU0	167 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	STPG3	Q8N7X2	389 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	ST8SIA2	Q92186	375 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF24	Q9Y225	148 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF546	Q86UE3	836 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXL17	Q9UF56	701 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	IGSF23	A1L1A6	192 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCL3	P19876	107 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	RAP2B	P61225	183 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL16	Q0P5N6	197 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	RETN	Q9HD89	108 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRY2	O43597	315 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	MPDU1	O75352	247 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	ORM2	P19652	201 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF183	Q96D59	192 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424		U3KQE9	123 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424		H0YIZ8	118 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	HYPM	O75409	117 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMLG	P49069	296 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	NHLH2	Q02577	135 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZRG5	221 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF126	Q9BV68	326 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	MBD2	Q9UBB5	411 aa		12.77	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	AGPAT2	O15120	278 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	BUB3	O43684	328 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00869	P0C866	280 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	TFPI2	P48307	235 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	VWC2	Q2TAL6	325 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF709	Q8N972	641 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	CSTL1	Q9H114	145 aa		12.76	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5G3	P0C626	314 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF7	P21781	194 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR82	Q96P67	336 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL6	Q9H0F7	186 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		12.75	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	RYR2	Q92736	4967 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	JTB	O76095	146 aa		12.74	□□□□□ -0.37

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