RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 C11orf94C9JXX5 98 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 WRBO00258 174 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 PSMB3P49720 205 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 TCTAP57738 103 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 RAB11AP62491 216 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 ID3Q02535 119 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 C12orf74Q32Q52 190 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 A8MTW9 85 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 IGLL5B9A064 214 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 H3BP45 60 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 MED6O75586 246 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 PAX9P55771 341 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 C20orf173Q96LM9 149 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 NEU1Q99519 415 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 F6UB75 175 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 FABP1P07148 127 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 DNAH2Q9P225 4427 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 A0A0J9YX75 114 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF98A6NK75 572 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 ISLRO14498 428 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 CCNKO75909 580 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 IGKV3-20P01619 116 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 ID1P41134 155 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 FXYD7P58549 80 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 AMTNQ6UX39 209 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00052Q96N35 136 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 RNF126Q9BV68 326 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 AGRNO00468 2067 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 H3BRN7 92 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 AMBPP02760 352 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 OR4E1P0C645 316 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 FAM78BQ5VT40 261 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 IL7P13232 177 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 ORM2P19652 201 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 MEOX2P50222 304 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 PSG9Q00887 426 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 AKR1C1Q04828 323 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 TRIQKQ629K1 86 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 COQ8AQ8NI60 647 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 SLC25A22Q9H936 323 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 PSENENQ9NZ42 101 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 PLA2G10O15496 165 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 SSSCA1O60232 199 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 GALR1P47211 349 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 PLP1P60201 277 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 SMIM8Q96KF7 97 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 RSG1Q9BU20 258 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 RPRMQ9NS64 109 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-211ENST00000467464 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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