RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 VSNL1P62760 191 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 HLA-DRB3P79483 266 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 PSG9Q00887 426 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 SSX1Q16384 188 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 MAJINQ3KP22 176 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 OR2G6Q5TZ20 316 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 GDF5OSQ5U4N7 250 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM236Q5W0B7 351 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 CGB2Q6NT52 195 aa2.58□□□□□ -2
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ECHDC1-211ENST00000460558 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 GID4Q8IVV7 300 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 Q8N377 158 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A46Q96AG3 418 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 TLCD1Q96CP7 247 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 LINC00479Q96M42 142 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 METTL26Q96S19 204 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 COMMD5Q9GZQ3 224 aa2.58□□□□□ -2
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ECHDC1-211ENST00000460558 BABAM2Q9NXR7 383 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 TAS2R4Q9NYW5 299 aa2.58□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 CLEC2DQ9UHP7 191 aa2.58□□□□□ -2
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ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0G2JND7 137 aa2.57□□□□□ -2
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ECHDC1-211ENST00000460558 RBFOX3A6NFN3 312 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL37AP8A6NKH3 93 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM212A6NML5 194 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 PRKYO43930 277 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 HRASP01112 189 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 SERPINE2P07093 398 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 MT3P25713 68 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 KRTAP10-8P60410 259 aa2.57□□□□□ -2
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ECHDC1-211ENST00000460558 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
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ECHDC1-211ENST00000460558 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa2.57□□□□□ -2
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ECHDC1-211ENST00000460558 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa2.57□□□□□ -2
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ECHDC1-211ENST00000460558 FOXI2Q6ZQN5 318 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 OR2T29Q8NH02 315 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 OR4S2Q8NH73 311 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5AK2Q8NH90 309 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 CYYR1Q96J86 154 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 C9orf85Q96MD7 179 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 CHCHD5Q9BSY4 110 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 FAAP24Q9BTP7 215 aa2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
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ECHDC1-211ENST00000460558 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
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ECHDC1-211ENST00000460558 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFAF8A1L188 74 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF98A6NK75 572 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 H7C423 109 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 INSP01308 110 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 PRM2P04554 102 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 HSD17B1P14061 328 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 CELP19835 753 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 CRYBB3P26998 211 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 RORCP51449 518 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 TAS2R43P59537 309 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 WFDC2Q14508 124 aa2.56□□□□□ -2
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF506Q5JVG8 444 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 AADACL4Q5VUY2 407 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 REG3GQ6UW15 175 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 TMUB2Q71RG4 321 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 PRSS48Q7RTY5 328 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 C6orf201Q7Z4U5 140 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 CROCCP2Q86T23 111 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM17Q86X19 198 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 WFDC10BQ8IUB3 73 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFP41Q8N8Y5 198 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 OR10W1Q8NGF6 305 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 OR10J5Q8NHC4 309 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB3CQ96E17 227 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 C16orf74Q96GX8 76 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 VSIG2Q96IQ7 327 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 SIKE1Q9BRV8 207 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 BET1LQ9NYM9 111 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 EHFQ9NZC4 300 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 RABL2BQ9UNT1 228 aa2.56□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF24Q9Y225 148 aa2.56□□□□□ -2
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