RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431908.5

DDX39B-210, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 5

Gene DDX39B, Length 914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-210ENST00000431908 PRR13Q9NZ81 148 aa8.72□□□□□ -1.01
DDX39B-210ENST00000431908 RABAC1Q9UI14 185 aa8.72□□□□□ -1.01
DDX39B-210ENST00000431908 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.71□□□□□ -1.01
DDX39B-210ENST00000431908 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 C11orf94C9JXX5 98 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 IGHV3-48P01763 117 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 DEFB131AP59861 70 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.71□□□□□ -1.02
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DDX39B-210ENST00000431908 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 METTL26Q96S19 204 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.71□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 E5RGE8 158 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 OR5AC1P0C628 307 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 S100A10P60903 97 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 LEMD1Q68G75 181 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 VSIRQ9H7M9 311 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 IGLL5B9A064 214 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 K7EPK0 472 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 SCO1O75880 301 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 CDS2O95674 445 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM50AO95807 157 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 OPRK1P41145 380 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 BLOC1S1P78537 153 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 SPINK9Q5DT21 86 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 GLYATL2Q8WU03 294 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 DEFB4AO15263 64 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 SPP1P10451 314 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 P2RY1P47900 373 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 SULT1A2P50226 295 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 TMED6Q8WW62 240 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 IL22RA2Q969J5 263 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 SMIM8Q96KF7 97 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 ARV1Q9H2C2 271 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 HELTA6NFD8 242 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 CLN5O75503 358 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 IGKV1-39P01597 117 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 IGKV1D-39P04432 117 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 MIFP14174 115 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 SP6Q3SY56 376 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 HRH4Q9H3N8 390 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 AGRNO00468 2067 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM218A2RU14 115 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 UCP1P25874 307 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 OR4X1Q8NH49 305 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 Q8WTZ3 238 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 TP53RKQ96S44 253 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 A0A1B0GU03 582 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 SEC11BP0C7V7 166 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF688P0C7X2 276 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 CRYBB3P26998 211 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 LILRB2Q8N423 598 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 LHFPL5Q8TAF8 219 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-210ENST00000431908 K7EQG2 157 aa8.64□□□□□ -1.03
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