RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ZNF600Q6ZNG1 722 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTB-201ENST00000331789 VN1R17PQ8TDU5 208 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTB-201ENST00000331789 TMEM68Q96MH6 324 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTB-201ENST00000331789 MS4A10Q96PG2 267 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTB-201ENST00000331789 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa13.97□□□□□ -0.17
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ACTB-201ENST00000331789 CHD6Q8TD26 2715 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTB-201ENST00000331789 CSMD2Q7Z408 3487 aa13.97□□□□□ -0.17
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ACTB-201ENST00000331789 H3BRN7 92 aa13.96□□□□□ -0.18
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ACTB-201ENST00000331789 C19orf54Q5BKX5 351 aa13.94□□□□□ -0.18
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ACTB-201ENST00000331789 TEX38Q6PEX7 206 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 C1QL4Q86Z23 238 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa13.94□□□□□ -0.18
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ACTB-201ENST00000331789 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 CLEC3BP05452 202 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF414Q96IQ9 312 aa13.93□□□□□ -0.18
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ACTB-201ENST00000331789 IGLV2-8P01709 118 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
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ACTB-201ENST00000331789 SRP14P37108 136 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 CNN1P51911 297 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZS46 218 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 CCDC140Q96MF4 163 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 C17orf77Q96MU5 243 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 RPH3ALQ9UNE2 315 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 TENM4Q6N022 2769 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 SCGB2A1O75556 95 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R60P59551 318 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 CLEC19AQ6UXS0 136 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.91□□□□□ -0.18
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ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PPQ1 181 aa13.9□□□□□ -0.18
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ACTB-201ENST00000331789 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 PITPNC1Q9UKF7 332 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 NAV2Q8IVL1 2488 aa13.9□□□□□ -0.18
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ACTB-201ENST00000331789 ISLRO14498 428 aa13.9□□□□□ -0.18
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ACTB-201ENST00000331789 IGLC2P0DOY2 106 aa13.9□□□□□ -0.18
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ACTB-201ENST00000331789 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 SGK494Q96LW2 274 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTB-201ENST00000331789 M0QZK8 103 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-201ENST00000331789 GGCTO75223 188 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
ACTB-201ENST00000331789 GCGP01275 180 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTB-201ENST00000331789 IGHV4-59P01825 116 aa13.89□□□□□ -0.19
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