RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR7C2O60412 319 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 HYPMO75409 117 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 AMY1AP04745 511 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 AKIRIN2Q53H80 203 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 A6NDX4 124 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSPAN4O14817 238 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSG1P11464 419 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 AKR1C3P42330 323 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 MFAP4P55083 255 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5T1Q8NG75 326 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM241Q24JQ0 296 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 TIGITQ495A1 244 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 LINC00305Q7Z4B0 112 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABCA1O95477 2261 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRAV5A0A0B4J249 113 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 TGFAP01135 160 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV4-31P0DP07 118 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM219Q86XT9 240 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 STXBP6Q8NFX7 210 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5AU1Q8NGC0 362 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1W2PRE2 83 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 ORM2P19652 201 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR51G1Q8NGK1 321 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR1B1Q8NGR6 318 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 C11orf52Q96A22 123 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 UHRF2Q96PU4 802 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 F8W735 103 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 TOMM40O96008 361 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 RD3LP0DJH9 198 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 C15orf54Q8N8G6 183 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 VN1R17PQ8TDU5 208 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 TXN2Q99757 166 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMUB1Q9BVT8 246 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 CR1P17927 2039 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 NDUFB8O95169 186 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 C21orf62Q9NYP8 219 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 M0QZK8 103 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF674Q2M3X9 581 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 C19orf54Q5BKX5 351 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 C16orf82Q7Z2V1 217 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAXXQ9BUH6 204 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR51M1Q9H341 326 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 PITPNC1Q9UKF7 332 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-210ENST00000574322 LINC01548A6NM66 108 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 COLCA2A8K830 154 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 H3BUX3 64 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 FSHBP01225 129 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM242Q9NWH2 141 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2J3O76001 311 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 NDUFB4O95168 129 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD99P14209 185 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 ECSCRQ19T08 205 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXL7Q9UJT9 491 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIGD1AQ9Y241 93 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAST4O15021 2626 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 GNG7O60262 68 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR10J4P0C629 311 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYB5R2Q6BCY4 276 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 FXYD5Q96DB9 178 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 CXorf65A6NEN9 183 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa22.23■■□□□ 1.15
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PRELID1Q9Y255 219 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCO2A0A1W2PP80 73 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 LYZP61626 148 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF491Q8N8L2 437 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 G3V318 75 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2C1O95371 312 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGF1P05019 195 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF343Q6P1L6 599 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 C9orf139Q6ZV77 190 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 YPEL4Q96NS1 127 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 SVEP1Q4LDE5 3571 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCGB2A1O75556 95 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHG2P01859 326 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 PYYP10082 97 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 NECAP1Q8NC96 275 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTDSP1Q9GZU7 261 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACANP16112 2415 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-210ENST00000574322 GGTLC3B5MD39 225 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q56UQ5 140 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF502Q8TBZ5 544 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 DERL1Q9BUN8 251 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM14CQ9P0S9 112 aa22.2■■□□□ 1.14
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