RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 KLRB1Q12918 225 aa15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 SAMD5Q5TGI4 173 aa15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 OR9G4Q8NGQ1 327 aa15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 CRXO43186 299 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 PSG1P11464 419 aa15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 FAM27E3Q08E93 113 aa15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 Q6P435 159 aa15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 LINC00205P59089 165 aa15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 SYT8Q8NBV8 401 aa15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.97■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 A0A0G2JLM5 398 aa15.96■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 GAGE12BA1L429 117 aa15.96■□□□□ 0.15
SUDS3-204ENST00000543473 C21orf62Q9NYP8 219 aa15.96■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 SFTA2Q6UW10 78 aa15.95■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 CACNA1BQ00975 2339 aa15.95■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 NPIPB6E9PJ23 425 aa15.95■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 DPM2O94777 84 aa15.95■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 GUSBP1Q15486 140 aa15.95■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 Q6ZWC4 215 aa15.95■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 IGHV3-23P01764 117 aa15.95■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF479Q96JC4 524 aa15.95■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 FAM74A4Q5TZK3 123 aa15.95■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.94■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa15.94■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 FABP5P3A8MUU1 101 aa15.94■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa15.94■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa15.94■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 PPBPP02775 128 aa15.94■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 IGLC2P0DOY2 106 aa15.94■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 IGLC3P0DOY3 106 aa15.94■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 C9orf106Q8NAJ2 232 aa15.94■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 PF4V1P10720 104 aa15.93■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 C10orf55Q5SWW7 151 aa15.93■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 EBLN2Q6P2I7 272 aa15.93■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 TGFAP01135 160 aa15.93■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 ERVK11-1P61568 191 aa15.93■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 PRSS8Q16651 343 aa15.93■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa15.93■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 SRRM5B3KS81 715 aa15.93■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 CD5LO43866 347 aa15.93■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 IGKV1D-33P01593 117 aa15.93■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 IGKV1-33P01594 117 aa15.93■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 RNF125Q96EQ8 232 aa15.92■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 DPM3Q9P2X0 92 aa15.92■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa15.92■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.92■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.92■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 IGKV3-15P01624 115 aa15.92■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 METRNQ9UJH8 293 aa15.92■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 ABCA1O95477 2261 aa15.92■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 SHANK1Q9Y566 2161 aa15.92■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 C8orf46Q8TAG6 207 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 LINC01560Q8TB33 94 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 SELLP14151 372 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF138P52744 262 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 PPP1R17O96001 155 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 FAM57AQ8TBR7 257 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 VKORC1Q9BQB6 163 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 VCX2Q9H322 139 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 IGKCP01834 107 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 GAGE1Q13065 139 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 PPP1R27Q86WC6 154 aa15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 TCRAP04437 139 aa15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF56Q15929 161 aa15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 MYO7BQ6PIF6 2116 aa15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 DOCK7Q96N67 2140 aa15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 MYOD1P15172 320 aa15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 C18orf32Q8TCD1 76 aa15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 LINC00479Q96M42 142 aa15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 PVRIGQ6DKI7 326 aa15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 FAM159AQ6UWV7 190 aa15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 Q0VFX4 171 aa15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SUDS3-204ENST00000543473 GAGE13Q4V321 117 aa15.89■□□□□ 0.13
SUDS3-204ENST00000543473 RNFT1Q5M7Z0 435 aa15.89■□□□□ 0.13
SUDS3-204ENST00000543473 ATP5G2Q06055 141 aa15.89■□□□□ 0.13
SUDS3-204ENST00000543473 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa15.89■□□□□ 0.13
SUDS3-204ENST00000543473 CYYR1Q96J86 154 aa15.89■□□□□ 0.13
SUDS3-204ENST00000543473 LOC105371242A0A075B767 164 aa15.89■□□□□ 0.13
SUDS3-204ENST00000543473 D6R8Y8 96 aa15.89■□□□□ 0.13
SUDS3-204ENST00000543473 ASIPP42127 132 aa15.89■□□□□ 0.13
SUDS3-204ENST00000543473 IL18BPO95998 194 aa15.89■□□□□ 0.13
SUDS3-204ENST00000543473 CD177Q8N6Q3 437 aa15.89■□□□□ 0.13
SUDS3-204ENST00000543473 IGKV1-39P01597 117 aa15.88■□□□□ 0.13
SUDS3-204ENST00000543473 IGKV1D-39P04432 117 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms