RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CA1P00915 261 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INPP1P49441 399 aa12.32□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPP30P78346 268 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DHRS2Q13268 280 aa12.32□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC35E1Q96K37 410 aa12.32□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFP92A6NM28 416 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FABP1P07148 127 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF688P0C7X2 276 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BAK1Q16611 211 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR8G2PQ6IF36 304 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR11H2Q8NH07 326 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF125Q96EQ8 232 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYNGR2O43760 224 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFB6O95139 128 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPP1P10451 314 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIQKQ629K1 86 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NRN1Q9NPD7 142 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C9orf170A2RU37 121 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNRPGP15A8MWD9 76 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXB5P09067 269 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IAPPP10997 89 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PMS2P11Q13670 270 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GGNBP1Q5YKI7 109 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB40CQ96S21 281 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRGV9Q99603 122 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HYDINQ4G0P3 5121 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CENPXA8MT69 81 aa12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF90Q03938 601 aa12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1orf194Q5T5A4 169 aa12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFA13Q9P0J0 144 aa12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGRNO00468 2067 aa12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KNCNA6PVL3 124 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WRBO00258 174 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFDP00746 253 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ID3Q02535 119 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNPY1Q3B7I2 92 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMG4Q5JS54 123 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACTL10Q5JWF8 245 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THAP8Q8NA92 274 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COQ8AQ8NI60 647 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PBDC1Q9BVG4 233 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MFFQ9GZY8 342 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAGT1Q9H0U3 335 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBXL17Q9UF56 701 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRSS46E5RG02 174 aa12.26□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR4E1P0C645 316 aa12.26□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.26□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAP1O75689 374 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFNA21P01568 189 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPANXN5Q5MJ07 72 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00476Q8WZB0 136 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FLVCR2Q9UPI3 526 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL7P13232 177 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIFP14174 115 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LYZP61626 148 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC45A2Q9UMX9 530 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H3BMM0 161 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C4BPBP20851 252 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BTCP35070 178 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ID1P41134 155 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR2F1Q13607 317 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q8NAQ8 132 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR4D5Q8NGN0 318 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HRH4Q9H3N8 390 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C4orf46Q504U0 113 aa12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAMD13Q5VXD3 122 aa12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR8I2Q8N0Y5 310 aa12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R14BQ96C90 147 aa12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMIM8Q96KF7 97 aa12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEFB4AO15263 64 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LY6G6CO95867 125 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HLA-DRB4P13762 266 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 S100A7P31151 101 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMB3P49720 205 aa12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms