RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 Q6ZWC4 215 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 BCL2L10Q9HD36 194 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 IRGMA1A4Y4 181 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 CD59P13987 128 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 PI3P19957 117 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 SPINT3P49223 89 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 TAS2R45P59539 299 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP1CAP62136 330 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 SPRNQ5BIV9 151 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 AAED1Q7RTV5 226 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 PRR15Q8IV56 129 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 BORCS8Q96FH0 119 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 TM2D1Q9BX74 207 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 FGF22Q9HCT0 170 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 SPTBP11277 2137 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 CHD6Q8TD26 2715 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 DPRXA6NFQ7 191 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 FCN1O00602 326 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 TRACP01848 142 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 PTHLHP12272 177 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 GP1BBP13224 206 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 P2RX1P51575 399 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 HBG1P69891 147 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 HBG2P69892 147 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 DPTQ07507 201 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 LCE3BQ5TA77 95 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB124Q8NES8 71 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAJA3Q96EY1 480 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 ZAR1LA6NP61 321 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 GNGT2O14610 69 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 LYZL6O75951 148 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 NUDT14O95848 222 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 PTHP01270 115 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 PYYP10082 97 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 LAGE3Q14657 143 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 RTL8BQ17RB0 113 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 MPV17LQ2QL34 196 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 MMD2Q8IY49 270 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGGTB-214ENST00000497648 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A096LPK6 155 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 C9JQL5 133 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 H3BUT2 72 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 JTBO76095 146 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF883P0CG24 379 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 FOXF1Q12946 379 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 EBI3Q14213 229 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 GAGE13Q4V321 117 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 PSMG4Q5JS54 123 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 OR52P1PQ8NH57 321 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 LMX1AQ8TE12 382 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 COX14Q96I36 57 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 MGAQ8IWI9 3026 aa7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129 ms