RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TEPPQ6URK8 271 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 BAGE3Q86Y29 109 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 BAGE2Q86Y30 109 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 STPG3Q8N7X2 389 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 A0A0U1RQK1 487 aa5.65□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 E7EUB6 86 aa5.65□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CLEC3BP05452 202 aa5.65□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.65□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 OR5AU1Q8NGC0 362 aa5.65□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 C10orf105Q8TEF2 133 aa5.65□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.65□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 MANBALQ9NQG1 85 aa5.65□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PRNDQ9UKY0 176 aa5.65□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 FOXH1O75593 365 aa5.65□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OPRK1P41145 380 aa5.65□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 RND2P52198 227 aa5.65□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP10-9P60411 292 aa5.65□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 FAM78BQ5VT40 261 aa5.65□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OR8I2Q8N0Y5 310 aa5.65□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 KLHDC1Q8N7A1 406 aa5.65□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.65□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OR2T10Q8NGZ9 312 aa5.65□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 H0YJW9 148 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TMEM250H0YL14 139 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 NUPR1O60356 82 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 MPDU1O75352 247 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 REG1AP05451 166 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 GNB1P62873 340 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 RAB31Q13636 194 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PRR31Q5SQ13 230 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ATOH7Q8N100 152 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OR9G1Q8NH87 305 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 RITA1Q96K30 269 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 LINC00574Q9H8X3 128 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 SPG11Q96JI7 2443 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CKS1BP61024 79 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PRCDQ00LT1 54 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PAX2Q02962 417 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 MUC15Q8N387 334 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V0BQ99437 205 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPR1 153 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 HYPMO75409 117 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 COX7A1P24310 79 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 POU2AF1Q16633 256 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZWC4 215 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ZNF114Q8NC26 417 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 AP1S3Q96PC3 154 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OR2T8A6NH00 312 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 STAG3L2P0CL84 134 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 KCNIP4Q6PIL6 250 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 SFRP2Q96HF1 295 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 NABP2Q9BQ15 211 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PDLIM4P50479 330 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 RHOBP62745 196 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ZNF580Q9UK33 172 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 B9A039 149 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CXorf1O96002 111 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OR10J4P0C629 311 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 AZU1P20160 251 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 GCHFRP30047 84 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 LGALS7P47929 136 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PAFAH1B2P68402 229 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 HCP5Q6MZN7 132 aa5.63□□□□□ -1.51
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