RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266		U3KQ87	197 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0QZK8	103 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCL2L11	O43521	198 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2J3	O76001	311 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT-CO2	P00403	227 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	RLN2	P04090	185 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00869	P0C866	280 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	HTR2B	P41595	481 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	RUNX1	Q01196	453 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2F1	Q13607	317 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF345	Q14585	488 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX29	Q8N6K0	151 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.71	□□□□□ -1.66	2e-7	■□□□□ 8
RABGGTB-212	ENST00000491266	YIF1A	O95070	293 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFA7	O95182	113 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRI3	O95415	125 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHG4	P01861	327 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSG1	P11464	419 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMB8	P28062	276 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	S100A11	P31949	105 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	DLK1	P80370	383 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RHOG	P84095	191 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	MGST2	Q99735	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0D9SG52	128 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNA4	P05014	189 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PET100	P0DJ07	73 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFA4	P12838	97 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNCA	P37840	140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB9A	P51151	201 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RND2	P52198	227 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF90	Q03938	601 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAX	Q07812	192 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP5S	Q99766	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCF21	O43680	179 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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