RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 AQP10Q96PS8 301 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 U3KQ87 197 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 F8W735 103 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ARPC5O15511 151 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 CXCL2P19875 107 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 RPL12P30050 165 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 SNCAP37840 140 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 MARC2Q969Z3 335 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 HYLS1Q96M11 299 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 A0A0J9YWU9 116 aa9.37□□□□□ -0.91
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PRAME-212ENST00000485532 CST7O76096 145 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ADMP35318 185 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 SULT1A1P50225 295 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 RPP30P78346 268 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ARL16Q0P5N6 197 aa9.37□□□□□ -0.91
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PRAME-212ENST00000485532 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 OR1P1Q8NH06 330 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 MFFQ9GZY8 342 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 HSPB11Q9Y547 144 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.912e-6■□□□□ 10
PRAME-212ENST00000485532 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 RAB11AP62491 216 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 NHLH2Q02577 135 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
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PRAME-212ENST00000485532 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 THYN1Q9P016 225 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 CXorf65A6NEN9 183 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 K7EIM0 57 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 TSPAN4O14817 238 aa9.35□□□□□ -0.91
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PRAME-212ENST00000485532 OR2F1Q13607 317 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ZNF345Q14585 488 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ZNF124Q15973 351 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 OR8G2PQ6IF36 304 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.35□□□□□ -0.91
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PRAME-212ENST00000485532 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.34□□□□□ -0.91
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PRAME-212ENST00000485532 SPRY2O43597 315 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 LY6G6CO95867 125 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-48P01763 117 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 Q56UQ5 140 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 TMUB2Q71RG4 321 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 MISP3Q96FF7 219 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 WFDC1Q9HC57 220 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 FBXL17Q9UF56 701 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 A0A0D9SG52 128 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 I3L2K1 104 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 CYB5BO43169 146 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 MT-CO2P00403 227 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 CTSGP08311 255 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 APOC4P55056 127 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 DLK1P80370 383 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 CLINT1Q14677 625 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 MLANAQ16655 118 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 OR1S2Q8NGQ3 325 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-212ENST00000485532 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.33□□□□□ -0.92
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