RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 BIRC6Q9NR09 4857 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 ZFP92A6NM28 416 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 FABP1P07148 127 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 C4BPBP20851 252 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 SLC35E1Q96K37 410 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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ACTB-212ENST00000484841 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 BUB3O43684 328 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 PSG1P11464 419 aa14.64□□□□□ -0.07
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ACTB-212ENST00000484841 RNF125Q96EQ8 232 aa14.64□□□□□ -0.07
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ACTB-212ENST00000484841 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 AP3S2P59780 193 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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ACTB-212ENST00000484841 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.62□□□□□ -0.07
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ACTB-212ENST00000484841 X6R8D5 127 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 ID1P41134 155 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 PYDC2Q56P42 97 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.61□□□□□ -0.07
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ACTB-212ENST00000484841 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 MED6O75586 246 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 LINC00052Q96N35 136 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 XCL2Q9UBD3 114 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 H3BMM0 161 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 VAMP1P23763 118 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 LYZP61626 148 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 GAMTQ14353 236 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZTC4 211 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 COQ8AQ8NI60 647 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 APLNQ9ULZ1 77 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-212ENST00000484841 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 H3BMQ9 156 aa14.58□□□□□ -0.08
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ACTB-212ENST00000484841 S100A5P33763 92 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 ZNF90Q03938 601 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 C1orf194Q5T5A4 169 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 SOSTQ9BQB4 213 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 CCDC160A6NGH7 325 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 IGKV3-20P01619 116 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 PSMB3P49720 205 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 OR2F1Q13607 317 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 S100A7P31151 101 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 TRGV9Q99603 122 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 RNF126Q9BV68 326 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.55□□□□□ -0.08
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ACTB-212ENST00000484841 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 SLC25A6P12236 298 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 PRR20EP86478 221 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 PRR20CP86479 221 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 PRR20DP86480 221 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 PRR20BP86481 221 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 PRR20AP86496 221 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 TMEM189A5PLL7 270 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 PITX3O75364 302 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 FXYD7P58549 80 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 LRTM2Q8N967 370 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-212ENST00000484841 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.53□□□□□ -0.08
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