RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 OR4C46A6NHA9 309 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 K7EPK0 472 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 PRAF2O60831 178 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 TSC22D2O75157 780 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 HAGHQ16775 308 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 ODF3L2Q3SX64 289 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 GSG1LQ6UXU4 331 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 TRGV9Q99603 122 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 UBQLN2Q9UHD9 624 aa11.71□□□□□ -0.53
ACTB-206ENST00000443528 A0A1W2PS18 150 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 CD5P06127 495 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 METTL15P1P0C7V9 234 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 P2RY1P47900 373 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 TFPI2P48307 235 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 OR8G2PQ6IF36 304 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 GBGT1Q8N5D6 347 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 RNF125Q96EQ8 232 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 U3KQK5 164 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 ARL16Q0P5N6 197 aa11.69□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 OR2F1Q13607 317 aa11.69□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.69□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 FAM110AQ9BQ89 295 aa11.69□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.69□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 SIX6O95475 246 aa11.68□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 DLK1P80370 383 aa11.68□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 RAB32Q13637 225 aa11.68□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.68□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.68□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 GLMPQ8WWB7 406 aa11.68□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 PBDC1Q9BVG4 233 aa11.68□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 RABAC1Q9UI14 185 aa11.68□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 L7N2F9 121 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 GOSR2O14653 212 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 BUB3O43684 328 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 FABP1P07148 127 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 LYZP61626 148 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 VAMP2P63027 116 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 PAFAH1B2P68402 229 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 AKR1C1Q04828 323 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 STPG3Q8N7X2 389 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 GRAMD2BQ96HH9 432 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 SMCO3A2RU48 225 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 FNDC10F2Z333 226 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 S100A10P60903 97 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 RCHY1Q96PM5 261 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 ZMAT4Q9H898 229 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 TENM3Q9P273 2699 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 K7EQG2 157 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 ZNF124Q15973 351 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 STXBP6Q8NFX7 210 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 DCANP1Q8TF63 244 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 NPVFQ9HCQ7 196 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTB-206ENST00000443528 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 HELTA6NFD8 242 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 DEDDO75618 318 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 PTTG1O95997 202 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 BCAP31P51572 246 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 CAV2P51636 162 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 H2BFSP57053 126 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 SPATA25Q9BR10 227 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 GGACTQ9BVM4 153 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 NMES1Q9C002 83 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 IGSF23A1L1A6 192 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 CST7O76096 145 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 RETNQ9HD89 108 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTB-206ENST00000443528 SSNA1O43805 119 aa11.62□□□□□ -0.55
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