RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 SCGB1D2O95969 90 aa7.94□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.143e-8■■■■■ 26.9
ATG4B-210ENST00000428861 OR2F1Q13607 317 aa7.94□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.94□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.94□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 THAP8Q8NA92 274 aa7.94□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 GLMPQ8WWB7 406 aa7.94□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 SLC35E1Q96K37 410 aa7.94□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 PSENENQ9NZ42 101 aa7.94□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.94□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PS18 150 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 ZFP92A6NM28 416 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 BUB3O43684 328 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 SCGB2A1O75556 95 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 ARL16Q0P5N6 197 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 LEMD1Q68G75 181 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 DCANP1Q8TF63 244 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 RNF125Q96EQ8 232 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM8Q96KF7 97 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 TRGV9Q99603 122 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 BATF3Q9NR55 127 aa7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 C7orf66A4D0T2 115 aa7.92□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 K7EQG2 157 aa7.92□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.92□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 BMI1P35226 326 aa7.92□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 DEFB131AP59861 70 aa7.92□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.92□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.92□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.92□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.92□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 RABAC1Q9UI14 185 aa7.92□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 FAM25EA8MYX2 175 aa7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 K7EPK0 472 aa7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 IL5P05113 134 aa7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 CD5P06127 495 aa7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 LYZP61626 148 aa7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 PAFAH1B2P68402 229 aa7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 IL15RAQ13261 267 aa7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 MUC7Q8TAX7 377 aa7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 ENKURQ8TC29 256 aa7.91□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 RYR3Q15413 4870 aa7.9□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 LYSTQ99698 3801 aa7.9□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 C5orf51A6NDU8 294 aa7.9□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF688P0C7X2 276 aa7.9□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 DEFB135Q30KP9 77 aa7.9□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 C17orf77Q96MU5 243 aa7.9□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 RAB40CQ96S21 281 aa7.9□□□□□ -1.14
ATG4B-210ENST00000428861 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
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ATG4B-210ENST00000428861 SMCO3A2RU48 225 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 HELTA6NFD8 242 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 KNCNA6PVL3 124 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 TSC22D2O75157 780 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SIX6O95475 246 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 TAS2R30P59541 319 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 AKR1C1Q04828 323 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 CASC10Q5T4H9 136 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 C2orf50Q96LR7 162 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 AGRNO00468 2067 aa7.89□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 C3orf84H3BNL1 204 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 APOC4P55056 127 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 DEFB1P60022 68 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 DLK1P80370 383 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 RAB32Q13637 225 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.88□□□□□ -1.15
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