RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD81P60033 236 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 TXNDC17Q9BRA2 123 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGLC1P0CG04 106 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 C10orf113Q5VZT2 155 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 PQLC2Q6ZP29 291 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 PITPNC1Q9UKF7 332 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPS13CQ709C8 3753 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 A6NDX4 124 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM250H0YL14 139 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 H3BUX3 64 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP6V0E1O15342 81 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 FABP1P07148 127 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5T1Q8NG75 326 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 C8orf88P0DMB2 117 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMUB1Q9BVT8 246 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM90A2PQ658T7 463 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM167BQ9NRX6 74 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 M0QZK8 103 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLP1P60201 277 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLK9Q2XQG4 91 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 AKIRIN2Q53H80 203 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 C16orf82Q7Z2V1 217 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR4F5Q8NH21 305 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR4F4Q96R69 305 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLK9Q9UKQ9 250 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 C11orf94C9JXX5 98 aa22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 MFAP4P55083 255 aa22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 ECSCRQ19T08 205 aa22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 PATE2Q6UY27 113 aa22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 DOK5Q9P104 306 aa22.89■■□□□ 1.26
CTDNEP1-208ENST00000573600 CELSR2Q9HCU4 2923 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 AMY1AP04745 511 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYB5R2Q6BCY4 276 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUN5Q8TC36 379 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 TENM4Q6N022 2769 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 M0R036 132 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBE2G2P60604 165 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 LY6EQ16553 131 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 POLQO75417 2590 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 H3BQ15 152 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDE6DO43924 150 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 TIGITQ495A1 244 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 AWAT1Q58HT5 328 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 CST9LP1Q5W188 147 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR7C2O60412 319 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 HYPMO75409 117 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 FSHBP01225 129 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 PSG1P11464 419 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 ORM2P19652 201 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 RHEBQ15382 184 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR1B1Q8NGR6 318 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 TVP23CQ96ET8 276 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 C21orf62Q9NYP8 219 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 F6UZH7 168 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNG7O60262 68 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2J3O76001 311 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFB8O95169 186 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV1-17P01599 117 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM74A3Q4VXF1 159 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC00305Q7Z4B0 112 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 VN1R17PQ8TDU5 208 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A2Q9BXI2 301 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXL7Q9UJT9 491 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC01548A6NM66 108 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCGB2A1O75556 95 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF503Q96F45 646 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 TXN2Q99757 166 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 RD3LP0DJH9 198 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 DEFB112Q30KQ8 113 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 C9orf139Q6ZV77 190 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5AU1Q8NGC0 362 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 C7orf77A4D0Y5 90 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM74A7A6NL05 159 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOMM40O96008 361 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP5G3P48201 142 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPS10P5Q9NQ39 176 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCA1O95477 2261 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCA12Q86UK0 2595 aa22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.4 ms