RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 GBF1Q92538 1859 aa14.03□□□□□ -0.16
NISCH-213ENST00000489895 PRSS2P07478 247 aa14.02□□□□□ -0.16
NISCH-213ENST00000489895 NBL1P41271 181 aa14.02□□□□□ -0.16
NISCH-213ENST00000489895 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
NISCH-213ENST00000489895 TSC2P49815 1807 aa14.02□□□□□ -0.16
NISCH-213ENST00000489895 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.02□□□□□ -0.16
NISCH-213ENST00000489895 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.02□□□□□ -0.16
NISCH-213ENST00000489895 C7orf71A4D174 169 aa14.02□□□□□ -0.16
NISCH-213ENST00000489895 TREML4Q6UXN2 200 aa14.02□□□□□ -0.16
NISCH-213ENST00000489895 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.02□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 MEIG1Q5JSS6 88 aa14.02□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 DTX1Q86Y01 620 aa14.02□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.02□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 ITGB1BP1O14713 200 aa14.02□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 LILRA1O75019 489 aa14.02□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 FABP2P12104 132 aa14.02□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.02□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 PSMB11A5LHX3 300 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 H0YJW9 148 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 TCTAP57738 103 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 DNLZQ5SXM8 178 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 COQ2Q96H96 371 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 PSG8Q9UQ74 426 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GWJ7 208 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 H3BVH4 76 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 WFDC1Q9HC57 220 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 OR11H12B2RN74 326 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 OR11H1Q8NG94 326 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 OR11H2Q8NH07 326 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 C2orf88Q9BSF0 95 aa14.01□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 DDTP30046 118 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 PLAURQ03405 335 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 HIGD1CA8MV81 97 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 E7EQL1 145 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 HGFACQ04756 655 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 TRGV9Q99603 122 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 CACNG7P62955 275 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 PYYP10082 97 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 SSC4DQ8WTU2 575 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 GPR179Q6PRD1 2367 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 C15orf32Q32M92 178 aa14□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 GGTLC1Q9BX51 225 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 KLRD1Q13241 179 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 GATA3P23771 443 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 PRTN3P24158 256 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 GNG5P63218 68 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 LINC01356Q8N9X3 169 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 SCGB3A1Q96QR1 104 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 WDR81Q562E7 1941 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1-5P01602 117 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 CD7P09564 240 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 COL8A2P25067 703 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 PIP4P1Q86T03 277 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 STAG3L3P0CL85 134 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 H3BUX3 64 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 C10orf55Q5SWW7 151 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 USMG5Q96IX5 58 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 PROK2Q9HC23 129 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 GAGE10A6NGK3 116 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 LINC00518Q8N0U6 118 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 K7ERU9 68 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 ZNF585BQ52M93 769 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 H3BRM9 83 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GW64 132 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 PPBPP02775 128 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 IMMP2LQ96T52 175 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 PTPRDP23468 1912 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 MED12Q93074 2177 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 GATA4P43694 442 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 TMEM170BQ5T4T1 132 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 Q8TCH9 128 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 ARL17AQ8IVW1 177 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 F2Z2F3 143 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 UQCRFS1P47985 274 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 GTSCR1Q86UQ5 136 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 TMEM160Q9NX00 188 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 PSG1P11464 419 aa13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms