RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 MED6O75586 246 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 DEDDO75618 318 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 IAPPP10997 89 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 DEFA4P12838 97 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 PAX9P55771 341 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 BTNL8Q6UX41 500 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 DTD1Q8TEA8 209 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 CLEC3BP05452 202 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 GPR183P32249 361 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 WT1-ASQ06250 92 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 FGL1Q08830 312 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 KLK9Q2XQG4 91 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 FAM209BQ5JX69 171 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 RAB40CQ96S21 281 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 A8MWP6 167 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 C1QBP02746 253 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 RLN2P04090 185 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 PET100P0DJ07 73 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A4P12235 298 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 SLC16A13Q7RTY0 426 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 THAP6Q8TBB0 222 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 SMIM8Q96KF7 97 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 ENY2Q9NPA8 101 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 E5RGE8 158 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 H3BP45 60 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 L7N2F9 121 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 JTBO76095 146 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 OR13C7P0DN81 318 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R30P59541 319 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 VAMP2P63027 116 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 OR2C3Q8N628 320 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 PSENENQ9NZ42 101 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 IGSF23A1L1A6 192 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 C15orf62A8K5M9 175 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 TSC22D2O75157 780 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 P2RY1P47900 373 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 MFAP2P55001 183 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 BSXQ3C1V8 233 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 ZFP69Q49AA0 526 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 CXorf58Q96LI9 332 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 OR2T8A6NH00 312 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 C8orf88P0DMB2 117 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 CAV2P51636 162 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 NOXA1Q86UR1 476 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 IL17DQ8TAD2 202 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.4□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 RNF222A6NCQ9 220 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 HMSDA8MTL9 139 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 TGOLN2O43493 480 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 IFNA10P01566 189 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 NPY1RP25929 384 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 HTR2BP41595 481 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 PMS2P11Q13670 270 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 C2orf83Q53S99 150 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ZNF546Q86UE3 836 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 ZNF114Q8NC26 417 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-212ENST00000485532 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.39□□□□□ -0.91
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