RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 SEM1Q6ZVN7 128 aa12.12□□□□□ -0.47
TOP3B-206ENST00000436282 KIR3DL3Q8N743 410 aa12.12□□□□□ -0.47
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa12.11□□□□□ -0.47
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GXF2 115 aa12.11□□□□□ -0.47
TOP3B-206ENST00000436282 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
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TOP3B-206ENST00000436282 RHOGP84095 191 aa12.08□□□□□ -0.47
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TOP3B-206ENST00000436282 OR2T6Q8NHC8 308 aa12.08□□□□□ -0.47
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TOP3B-206ENST00000436282 MPV17L2Q567V2 206 aa12.08□□□□□ -0.48
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TOP3B-206ENST00000436282 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 K7EM74 188 aa12.07□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 REG1BP48304 166 aa12.07□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.07□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF318Q5VUA4 2279 aa12.07□□□□□ -0.48
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TOP3B-206ENST00000436282 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 TAX1BP3O14907 124 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 MYCNOSP40205 109 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
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TOP3B-206ENST00000436282 PATE2Q6UY27 113 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 PCNX1Q96RV3 2341 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
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TOP3B-206ENST00000436282 GNG5P63218 68 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 WASHC3Q9Y3C0 194 aa12.06□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
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TOP3B-206ENST00000436282 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A34Q6PIV7 304 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 TCF24Q7RTU0 167 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 DEFB108BQ8NET1 73 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 ITLN1Q8WWA0 313 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 FAM215AQ9Y5M1 114 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 hDV102S1A0JD36 115 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 FSTL3O95633 263 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 NUDT3O95989 172 aa12.05□□□□□ -0.48
TOP3B-206ENST00000436282 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
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