RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 TMEM250H0YL14 139 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 J3QKU1 62 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 PDE6DO43924 150 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 VENTXO95231 258 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 STAG3L2P0CL84 134 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 STAG3L3P0CL85 134 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 LMO4P61968 165 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 PRSS8Q16651 343 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 DUX5Q96PT3 197 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 RD3LP0DJH9 198 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 RPL29P47914 159 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 SSTP61278 116 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 OR5I1Q13606 314 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 VWC2Q2TAL6 325 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 MALSU1Q96EH3 234 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 MS4A10Q96PG2 267 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 FUT9Q9Y231 359 aa10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 HIVEP2P31629 2446 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 CSMD1Q96PZ7 3565 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 C2orf83Q53S99 150 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 OR2T10Q8NGZ9 312 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 B4DEV8 164 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 M0R1W7 72 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 SLC17A3O00476 420 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 NBR2O15453 112 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 CLN5O75503 358 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 TNFRSF14Q92956 283 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 LINC00574Q9H8X3 128 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 GNB4Q9HAV0 340 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 FAM106CPP0CH98 169 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 NPPCP23582 126 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 POU2AF1Q16633 256 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 FAM120AOSQ5T036 256 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 DYNAPQ8N1N2 210 aa10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 ITPR3Q14573 2671 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 HELTA6NFD8 242 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 GNG4P50150 75 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 BPIFB3P59826 476 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 LINC00311Q8N616 119 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 ZNF114Q8NC26 417 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 BEND2Q8NDZ0 799 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 LINC00305Q7Z4B0 112 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 MORN5Q5VZ52 161 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 PAXXQ9BUH6 204 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 WNT10AQ9GZT5 417 aa10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 C8orf88P0DMB2 117 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 TIGITQ495A1 244 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 TUBA4BQ9H853 241 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 ITPR2Q14571 2701 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 AP4M1O00189 453 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 PPP1R2P9O14990 202 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 OCC1Q8TAD7 63 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 LINC00479Q96M42 142 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 NPFFO15130 113 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 Q56UQ5 140 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 Q5PR19 223 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 NIT2Q9NQR4 276 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 TMEM167BQ9NRX6 74 aa10.66□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 PRSS46E5RG02 174 aa10.65□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 IGLV2-23P01705 113 aa10.65□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa10.65□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 C1orf159Q96HA4 380 aa10.65□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 TBX15Q96SF7 602 aa10.65□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 MSMBP08118 114 aa10.65□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.65□□□□□ -0.7
HCN3-201ENST00000368358 SEC14L6B5MCN3 397 aa10.65□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 TRGC1P0CF51 173 aa10.65□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 GFI1BQ5VTD9 330 aa10.65□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 ETFRF1Q6IPR1 90 aa10.65□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa10.65□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 OR10G8Q8NGN5 311 aa10.65□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 CSMD2Q7Z408 3487 aa10.64□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 A0A087WWC5 75 aa10.64□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 OR2J3O76001 311 aa10.64□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 CX3CL1P78423 397 aa10.64□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 TEX45Q8NA69 505 aa10.64□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.64□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 OVOL3O00110 214 aa10.64□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 FABP4P15090 132 aa10.64□□□□□ -0.71
HCN3-201ENST00000368358 OR1L4Q8NGR5 311 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.3 ms