RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPG2	P98160	4391 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT3	O95989	172 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF2	P09038	288 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB3B	P20337	219 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXI1	Q12951	378 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	MSMO1	Q15800	293 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	POU2AF1	Q16633	256 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf74	Q32Q52	190 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZNX1	250 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TPRA1	Q86W33	373 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM17	Q86X19	198 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	COMMD9	Q9P000	198 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	CELA1	Q9UNI1	258 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	NSG2	Q9Y328	171 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	KNCN	A6PVL3	124 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	SCGN	O76038	276 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	PPY	P01298	95 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-48	P01763	117 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	PTHLH	P12272	177 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	C4BPB	P20851	252 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	BEST4	Q8NFU0	473 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	MOB3A	Q96BX8	217 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TXN2	Q99757	166 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM30	A4D0T7	59 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS10	O43665	173 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	MT-CO2	P00403	227 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	KRAS	P01116	189 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF688	P0C7X2	276 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	HERV-K104	P61576	105 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1P1	Q8NH06	330 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	BORCS5	Q969J3	196 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	MGLL	Q99685	303 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	VCX	Q9H320	206 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	PRND	Q9UKY0	176 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PS18	150 aa		7.76	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK2AP2	O75956	126 aa		7.76	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	RLN1	P04808	185 aa		7.76	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	FCER2	P06734	321 aa		7.76	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	NPBWR1	P48145	328 aa		7.76	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	EMP1	P54849	157 aa		7.76	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		7.76	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		7.76	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	VSIR	Q9H7M9	311 aa		7.76	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	7.76	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511		I3L2K1	104 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	SSX5	O60225	188 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	HTN3	P15516	51 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	NPPC	P23582	126 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	G6PC	P35575	357 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	LPAR6	P43657	344 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZR54	194 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	TSC22D3	Q99576	134 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	CD74	P04233	296 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	F2R	P25116	425 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM210B	Q96KR6	192 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL26	Q96S19	204 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	XCL2	Q9UBD3	114 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EQG2	157 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	SCGB2A1	O75556	95 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RY1	P47900	373 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	DHRS2	Q13268	280 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF212	Q495C1	297 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMG4	Q5JS54	123 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	C22orf42	Q6IC83	251 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	HOGA1	Q86XE5	327 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SKAP2-209	ENST00000497511	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		7.73	□□□□□ -1.17

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